Grep Teil der Zeichenfolge nach Symbol und Shuffle-Spalten

Question

Ich möchte die Nummer nach dem - Zeichen nehmen und ist als Spalte 2 in meiner Matrix. Ich weiß, wie man die Zeichenfolge grep aber nicht wie man es nach der Textzeichenfolge druckt.

in:

1-967764  GGCTGGTCCGATGGTAGTGGGTTATCAGAACT 
3-425354  GCATTGGTGGTTCAGTGGTAGAATTCTCGCC 
4-376323  GGCTGGTCCGATGGTAGTGGGTTATCAGAAC 
5-221398  GGAAGAGCACACGTCTGAACTCCAGTCACGTGAAAATCTCGTATGCCGTCT 
6-180339  TCCCTGGTGGTCTAGTGGTTAGGATTCGGCGCT 

aus:

GGCTGGTCCGATGGTAGTGGGTTATCAGAACT 967764 
GCATTGGTGGTTCAGTGGTAGAATTCTCGCC 425354 
GGCTGGTCCGATGGTAGTGGGTTATCAGAAC 376323 
GGAAGAGCACACGTCTGAACTCCAGTCACGTGAAAATCTCGTATGCCGTCT 221398 
TCCCTGGTGGTCTAGTGGTTAGGATTCGGCGCT 180339 

Answer 1

awk -F'[[:space:]-]+' '{print $3,$2}' file 

Answer 2

Scheint wie eine einfache Substitution sollte die Arbeit machen:

sed -E 's/[0-9]+-([0-9]+)[[:space:]]*(.*)/\2 \1/' file 

Capture-Teilen Sie interessiert sind und sie zu nutzen im Ersatz.

Alternativ awk mit:

awk 'sub(/^[0-9]+-/, "") { print $2, $1 }' file 

die führenden Ziffern entfernen und - von Anfang der Zeile. Wenn dies erfolgreich ist, gibt sub den Wert true zurück, so dass die Aktion ausgeführt wird und das zweite Feld gefolgt von dem ersten Feld gedruckt wird.

Answer 3

Mit regex (+|-) als Feldtrennzeichen:

$ awk -F"(+|-)" '{print $3,$2}' file 
GGCTGGTCCGATGGTAGTGGGTTATCAGAACT 967764 
GCATTGGTGGTTCAGTGGTAGAATTCTCGCC 425354 
GGCTGGTCCGATGGTAGTGGGTTATCAGAAC 376323 
GGAAGAGCACACGTCTGAACTCCAGTCACGTGAAAATCTCGTATGCCGTCT 221398 
TCCCTGGTGGTCTAGTGGTTAGGATTCGGCGCT 180339 

Answer 4

hier ist ein weiterer awk

$ awk 'split($1,a,"-") {print $2,a[2]}' file 

Answer 5

awk '{sub(/.-/,"");print $2,$1}' file 
GGCTGGTCCGATGGTAGTGGGTTATCAGAACT 967764 
GCATTGGTGGTTCAGTGGTAGAATTCTCGCC 425354 
GGCTGGTCCGATGGTAGTGGGTTATCAGAAC 376323 
GGAAGAGCACACGTCTGAACTCCAGTCACGTGAAAATCTCGTATGCCGTCT 221398 
TCCCTGGTGGTCTAGTGGTTAGGATTCGGCGCT 180339