Ich möchte hclust verwenden, um Daten zu gruppieren. Aber ich möchte nicht "dist()" verwenden, um das dist-Objekt zu generieren. Dann habe ich herausgefunden, dass ich keine symetrische Matrix als Entfernungsmatrix in hclust übergeben kann.Wie konvertiert man eine symmetrische Matrix in ein "dist" -Objekt?
Wie konvertiert man eine symmetrische Matrix in ein "dist" -Objekt?
Es klingt, als ob Sie bereits eine Matrix berechnet haben und diese in hclust verwenden möchten. Wie @shadow sagte, können Sie as.dist(yourMatrix) verwenden, um in das dist-Format zu konvertieren.
eine symmetrische Entfernungstabelle Gegeben:
> yourMatrix<-matrix(c(1,2,3,4,2,1,2,1,3,2,1,3,4,1,3,1), nrow=4)
[,1] [,2] [,3] [,4]
[1,] 1 2 3 4
[2,] 2 1 2 1
[3,] 3 2 1 3
[4,] 4 1 3 1
>
>as.dist(yourMatrix)
1 2 3
2 2
3 3 2
4 4 1 3
Vergewissern Sie sich, dass die Werte in der Matrix sind Unähnlichkeit oder Abstandsmetriken eher als Ähnlichkeitswerte.
Ist das, was Sie brauchen? dist(matrix(1:16, nrow=4))