Gibt es sowas wie requirements.txt für R?

Question

Gibt es eine Funktionalität wie requirements.txt in Python, wo Sie eine Liste der verwendeten Pakete in einer Datei speichern können, und wenn andere Leute Ihre Programme ausführen wollen und die Abhängigkeiten installieren müssen, können sie einfach pip install -r requirements.txt tun.

Ich denke, das hilft viel bei der Bereitstellung von R-Skript in die Produktion. Wenn es keine solche Funktionalität gibt, wie repliziere ich sie?

Answer 1

Gemäß den Kommentaren möchten Sie möglicherweise ein Paket erstellen und die Anforderungen in der Datei DESCRIPTION einschließen. Wenn Sie davon sprechen, ein .R-Skript in Produktion zu nehmen, können Sie am Anfang eine Funktion einfügen, um sicherzustellen, dass die erforderlichen Pakete installiert sind. Hier ist etwas, das ich in meinem eigenen Paket habe, und ich kann pkgLoad(<list of packages>) am Anfang jedes Skripts aufrufen, um sicherzustellen, dass die Pakete installiert und geladen werden. Ich schließe eine Liste meiner Lieblingspakete, so dass ein Anruf von pkgLoad() installiert und lädt alle meine üblichen Verdächtigen:

pkgLoad <- function(packages = "favourites") { 

    if(length(packages) == 1L && packages == "favourites") { 
     packages <- c("data.table", "chron", "plyr", "dplyr", "shiny", 
         "shinyjs", "parallel", "devtools", "doMC", "utils", 
         "stats", "microbenchmark", "ggplot2", "readxl", 
         "feather", "googlesheets", "readr", "DT", "knitr", 
         "rmarkdown", "Rcpp" 
     ) 
    } 

    packagecheck <- match(packages, utils::installed.packages()[,1]) 

    packagestoinstall <- packages[ is.na(packagecheck) ] 

    if(length(packagestoinstall) > 0L) { 
     utils::install.packages(packagestoinstall, 
          repos = "http://cran.csiro.au" 
     ) 
    } else { 
     print("All requested packages already installed") 
    } 

    for(package in packages) { 
     suppressPackageStartupMessages(
      library(package, character.only = TRUE, quietly = TRUE) 
     ) 
    } 

} 

Hinweis Ich habe meine Lieblings CRAN Spiegel in die Funktion eingebaut, so stellen Sie sicher, dass bearbeiten für deine eigenen Bedürfnisse.