Verwendung von Embassy-Phylipnew in Python

Question

Ich habe bereits embassy-phylipnew in meinem System installiert. Und ich finde heraus, wie man es in Python verwendet. Schlechtes Ding, dass es keine Dokumentation gibt, die ich finden kann.

Kann jemand es benutzen? Ich versuche dies zu benutzen, um Phylips Dnadist und Nachbar in der Befehlszeile auszuführen.

Answer 1

Es ist Dokumentation:

http://emboss.sourceforge.net/apps/cvs/embassy/phylipnew/

Wenn Sie es von Python verwenden möchten, finden Sie eine Befehlszeilenschnittstelle wie die subprocess Modul verwenden. Biopython erleichtert das Lesen des Ausgabeformats fneighbor (Newick) mit dem Code Bio.Phylo.