2017-02-01 1 views
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Ich habe einen großen Datensatz in Form einer .tar.gz-Datei heruntergeladen.Wie konvertieren Sie eine .h5-Datei in .csv?

Entpacken ergibt mehrere Ordner mit Daten und jede einzelne Datei hat die Form einer .h5-Datei. Ich muss die Daten in ein .csv oder .tsv Format umwandeln, so dass ich es leicht importieren und in R verwenden kann.

Kann mir jemand sagen, wie das geht?

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'tar xzvf filename.tar.gz' entpackt die TAR-Datei. Dieser Teil ist einfach. Ihre eigentliche Frage scheint zu sein, was die h5-Dateien zu tun haben. – Paul

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Wenn dies eine öffentliche Datenmenge ist, könnten Sie vielleicht einen Link bereitstellen, damit andere Personen Ihnen besser helfen können. – Paul

Antwort

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Ich bin mir nicht sicher, welches Betriebssystem Sie verwenden, aber hier ist eine Manpage für Teer. man tar

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Sie können .h5-Dateien mit R unter Verwendung der Pakete rhdf5 (Bioleiter, nicht CRAN) oder h5 lesen. Viele .h5-Dateien enthalten dünn besetzte Matrizen, sodass nachgeschaltete Anwendungen möglicherweise in standardmäßige Matrixform konvertiert werden müssen.

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