h5py setup.py auf Mac: hdf5.h Datei nicht gefunden

Question

Ich baue h5py auf Mac, folgende Anweisungen "Building gegen Parallel HDF5" in diesem Link: http://docs.h5py.org/en/latest/build.html

$ export CC=mpicc 
$ python setup.py configure --mpi 
$ sudo python setup.py build 

ich diesen Fehler:

h5py-2.5.0/h5py/api_compat.h:27:10: fatal error: 'hdf5.h' file not found 

Was soll ich tun? Wenn ich eine dev Version von HDF5 installieren muss, wie kann ich das auf dem Mac machen?

Answer 1

Ich erhielt gestern die gleiche Fehlermeldung, die eine allgemeine Installation von HDF5 (nicht gegen parallel). Ich konnte es umgehen, indem ich Homebrew (ein Paket-Manager für OS X, der hier gefunden werden kann: http://brew.sh/).

Sobald Sie Homebrew installiert haben (falls Sie es noch nicht haben), lautet der Befehl brew install hdf5.

Answer 2

Sie können hdf5.h lib in Ihrem Unix finden und setzen in cPath varible

freebsd 11 Beispiel:

>> find /usr -iname "*hdf5.h*" 
<< /usr/local/include/hdf5.h 
>> export CPATH="/usr/local/include/" 

Dann können Sie kompilieren, dass Sie