Verpacken Biom für FreeBSD

Question

Ich arbeite an der Verpackung biom (2.1.5) für FreeBSD.

Auf der Grundlage der Dokumentation, ich hatte anfangs je auf pynumpy und h5py, aber ich denke, es gräbt auch davon abhängen sollte:

py27-click-6.6 
py27-future-0.14.3 
py27-pyqi-0.2.0 
py27-scipy-0.16.1. 

Jetzt habe ich an dem Punkt bin, wo biom die unten angegebenen Fehler gibt läuft . Haben Sie Vorschläge zum Debuggen? Ich bin kein Python-Entwickler, also sei bitte sanft.

Traceback (most recent call last): 
    File "/usr/local/bin/biom", line 9, in <module> 
    load_entry_point('biom-format==2.1.5', 'console_scripts', 'biom')() 
    File "/usr/local/lib/python2.7/site-packages/pkg_resources/__init__.py", line 547, in load_entry_point 
    return get_distribution(dist).load_entry_point(group, name) 
    File "/usr/local/lib/python2.7/site-packages/pkg_resources/__init__.py", line 2720, in load_entry_point 
    return ep.load() 
    File "/usr/local/lib/python2.7/site-packages/pkg_resources/__init__.py", line 2380, in load 
    return self.resolve() 
    File "/usr/local/lib/python2.7/site-packages/pkg_resources/__init__.py", line 2386, in resolve 
    module = __import__(self.module_name, fromlist=['__name__'], level=0) 
    File "/usr/local/lib/python2.7/site-packages/biom/__init__.py", line 51, in <module> 
    from .table import Table 
    File "/usr/local/lib/python2.7/site-packages/biom/table.py", line 188, in <module> 
    from future.utils import string_types 
ImportError: cannot import name string_types 

Answer 1

In Zukunft 0.14.3 gibt es keine string_types in future.utils. (Obwohl es in der Dokumentation erwähnt wird). Sehen Sie sich den 0.14.x Zweig der github repo for future an.

Zum Zeitpunkt des Schreibens der aktuellen Version der future module ist 0.15.2. Dieser Port muss aktualisiert werden, bevor Biom funktionieren kann. Ich würde vorschlagen, den Betreuer dieses Hafens zu kontaktieren.