Unerwartete Pfeilfarbe Verhalten mit halbtransparenten Kanten (igraph, R)

Question

Mit dem igraph-Paket in R, bin ich auf das folgende unerwartete Verhalten gekommen. Wenn die edge.arrow.mode für eine Grafik (in meinem Fall ungerichtet, aber es macht keinen Unterschied) als 3 (oder "<->", Pfeile an beiden Enden) angegeben wird, und die edge.color als rgb() mit Option alpha < 1 angegeben wird, werden die Pfeile differentiell gefärbt. Es sieht so aus, als ob sich an einem Ende zwei Pfeilspitzen befinden und die Überlappung eine dunklere Farbe erzeugt.

Dies ist unerwünscht, da das Diagramm einige Pfeile als dunkler (die "wichtiger" aussehen) als andere zeigt. Der eigentliche Graph, den ich zu visualisieren versuche, ist ungerichtet, die Pfeile an den Enden der (alle grauen, halbtransparenten) Kanten würden nur verwendet, um zu veranschaulichen, wie viele Verbindungen ein bestimmter Vertex hat (der Graph ist ziemlich groß (100-500) Vertices), mit überlappenden Kanten, so dass es nicht einfach ist, visuell zu bestimmen, wo eine Kante mit einem Scheitelpunkt verbunden ist, was auch der Grund ist, halbtransparente Kanten und Scheitelpunkte zu verwenden.

Hier sind einige Arbeitsbeispiele:

library("igraph") 
plot(make_tree(5, mode="undirected"), vertex.size=10, edge.arrow.mode=3, edge.color=rgb(0,0,0,0.2)) 
plot(make_tree(5, mode="undirected"), vertex.size=10, edge.arrow.mode=3, edge.color=rainbow(5, alpha=0.3)) 

Die Frage ist, ist es eine Möglichkeit, diese um, so die Pfeile alle aussehen würde das gleiche? Die Anzahl (und vorzugsweise die "Richtung") der Verbindungen der Scheitelpunkte kann visuell auch auf andere Weise angezeigt werden (aber beachten Sie, dass die Scheitelpunktfarbe (Vollfarbspektrum) bereits für eine andere visuelle Hilfe verwendet wird, und ...) Vertex Kantenfärbung darüber würde die Dinge zu Regenbogenfarben machen. Das Verändern der Eckenform, um den Grad der Verbundenheit anzugeben, ist auch keine gute Lösung (Bearbeiten - dank Tad). Es wäre auch gut, alle Pfeilspitzen zu einer Vollfarbe zu machen (aber es scheint keine Möglichkeit zu bestehen, die Pfeilfarbe getrennt von der Kantenfarbe zu ändern).

(Bonus: ist das ein Bug oder ein Feature von IGRAPH?)

Answer 1

Könnten Sie einfach Vertex Größe ändern Knotengrad basierend auf?

grph <- make_tree(5, mode="undirected") 
plot(grph, vertex.size=degree(grph)*5, edge.arrow.mode=0, 
    edge.color='black') 

Es ist auch möglich, die Dicke der Kanten (edge.width) zu ändern, die eine Vorstellung von Knotenfestigkeit in einem gewichteten Netzwerk geben könnte. Dies gilt jedoch nicht wirklich.

Bearbeiten: Was ist mit der Änderung des Alpha-Kanals der Farbe, so dass mehr transparente Knoten einen kleineren Grad haben? Ansonsten bin ich ratlos. Pfeile auf einen ungerichteten Graphen zu setzen, erscheint im Allgemeinen als eine schlechte Idee, besonders wenn es nur ein Mittel ist, um den Grad des Knotens zu visualisieren.

colShift <- function(x, alpha){ 
         x <- col2rgb(x)/255 
         rgb(x[1], x[2], x[3], alpha=alpha) 
        } 

grph <- make_tree(5, mode="undirected") %>% 
     set_vertex_attr('color', value='dodgerblue4') 

vertAlpha <- 1.1 - 1/degree(grph) 
vertColor <- colShift(vertex_attr(grph, 'color'), vertAlpha) 

V(grph)$color <- vertColor 

plot(grph, vertex.size=degree(grph)*5, edge.arrow.mode=0, 
    edge.color='black')