I awk
bin mit %
jedes id
berechnen die unter Verwendung, die läuft und ist ganz in der Nähe, außer wenn der #
bei der Berechnung verwendet werden, ist gleich Null. Ich bin mir nicht sicher, wie man diese Bedingung in die awk
, wie es häufig vorkommt, kodiert. Vielen Dank :).awk Berechnung nicht in Fällen, in denen Null verwendet wird
file1
ABCA2 9 232
ABHD12 211 648
ABL2 83 0
file2
CC2D2A 442
(CCDC114) 0
awk mit Fehler
awk 'function ceil(v) {return int(v)==v?v:int(v+1)}
> NR==FNR{f1[$1]=$2; next}
> $1 in f1{print $1, ceil(10000*(1-f1[$1]/$3))/100 "%"}' all_sorted_genes_base_counts.bed all_sorted_total_base_counts.bed > total_panel_coverage.txt
awk: cmd. line:3: (FILENAME=file1 FNR=3) fatal: division by zero attempted
Welches Ergebnis sollten Sie bekommen, wenn '$ 3' Null ist? 'N/A'? – dawg
Ich entschuldige mich dafür, dass ich nicht beide Eingabedateien gepostet habe und werde meinen Post bearbeiten .... Es tut mir leid, dass ich in eine Besprechung gerannt bin. Vielen Dank :). – Chris
"N/A" wäre perfekt ... Danke :). – Chris