Wie konvertiere ich CSV-String in die Liste in Pandas?

Question

Ich bin mit einer CSV-Datei arbeiten, die das folgende Format hat:

"Id","Sequence" 
3,"1,3,13,87,1053,28576,2141733,508147108,402135275365,1073376057490373,9700385489355970183,298434346895322960005291,31479360095907908092817694945,11474377948948020660089085281068730" 
7,"1,2,1,5,5,1,11,16,7,1,23,44,30,9,1,47,112,104,48,11,1,95,272,320,200,70,13,1,191,640,912,720,340,96,15,1,383,1472,2464,2352,1400,532,126,17,1,767,3328,6400,7168,5152,2464,784,160,19,1,1535,7424" 
8,"1,2,4,5,8,10,16,20,32,40,64,80,128,160,256,320,512,640,1024,1280,2048,2560,4096,5120,8192,10240,16384,20480,32768,40960,65536,81920,131072,163840,262144,327680,524288,655360,1048576,1310720,2097152" 
11,"1,8,25,83,274,2275,132224,1060067,3312425,10997342,36304451,301432950,17519415551,140456757358,438889687625,1457125820233,4810267148324,39939263006825,2321287521544174,18610239435360217" 

Ich möchte dies in einem Datenrahmen lesen mit der Art der df['Id'] integer artig und die Art der df['Sequence'] zu sein, sei listartig.

ich zur Zeit die folgenden kludgy Code haben:

def clean(seq_string): 
    return list(map(int, seq_string.split(','))) 

# Read data 
training_data_file = "data/train.csv"  
train = pd.read_csv(training_data_file) 
train['Sequence'] = list(map(clean, train['Sequence'].values)) 

Dies scheint zu funktionieren, aber ich fühle mich wie das gleiche erreicht werden könnte nativ Pandas und numpy verwenden.

Hat jemand eine Empfehlung?

Answer 1

Sie können eine converter für die Sequence Spalte angeben:

converters: dict, zum Umwandeln Werte in bestimmten Spalten None

Dict von Funktionen Standard. Keys können entweder ganze Zahlen oder Spalte Etiketten

train = pd.read_csv(training_data_file, converters={'Sequence': clean}) 

Answer 2

Dies funktioniert auch, außer dass die Sequence ist Liste der Zeichenfolge statt Liste von int:

df = pd.read_csv(training_data_file) 
df['Sequence'] = df['Sequence'].str.split(',') 

jedes Element zu konvertieren int:

df = pd.read_csv(training_data_file) 
df['Sequence'] = df['Sequence'].str.split(',').apply(lambda s: list(map(int, s)))