Cat Befehl gibt "Keine solche Datei oder Verzeichnis"

Question

Ich versuche, dieses Skript zu verwenden, um eine Liste von Dateinamen (einschließlich ihres Pfades) zu erstellen und jeden Pfad durch ein Komma getrennt zu haben, also würde eine Ausgabe wie folgt aussehen: file1 .txt, file2.txt, file3.txt ... usw. Wie gehe ich vor?

#!/bin/bash 
LEFT=/home/ndevon/USER/SRA/PE/*_1.fastq.gz 
for f in $LEFT; do 
    cat "${f}," >> /home/ndevon/USER/left_list.txt 
done 

Answer 1

Was Sie wollen, ist wahrscheinlich

echo /home/ndevon/USER/SRA/PE/*_1.fastq.gz | tr ' ' , 

die Räume Komma übersetzt. Dies funktioniert, solange Ihre Dateinamen keine Leerzeichen enthalten.

Answer 2

Versuchen Sie folgendes:

# read the filenames into an array 
files=(/home/ndevon/USER/SRA/PE/*_1.fastq.gz) 

# print the filenames comma-separated 
IFS=, 
echo "${files[*]}" > output_file