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Es in broom
Website erwähnt wird, dass es für TukeyHSD
und multcomp
verwendet werden kann (here sehen). Jedoch konnte ich nicht herausfinden, wie man broom
für und multcomp
verwendet.TukeyHSD und multcompView mit dplyr und Besen in der R
Siehe MWE unten gegeben.
df1 <- data.frame(
Rep = factor(rep(1:3, each = 4, times = 2)),
Trt = rep(paste0("T", 1:4), times = 6),
Loc = rep(paste0("Loc", 1:2), each = 12),
Y = rnorm(24)
)
library(dplyr)
df2 <- filter(df1, Loc=="Loc1")
fm1 <- aov(Y ~ Rep + Trt , data = df2)
anova(fm1)
library(multcompView)
fm1Tukey1 <-
data.frame(Letter = multcompLetters(TukeyHSD(fm1)$Trt[, "p adj"])$Letters)
fm1Tukey <- data.frame(Trt = row.names(fm1Tukey1), fm1Tukey1)
fm1Means1 <-
data.frame(
Mean = as.matrix(model.tables(x = fm1, type = "means")[[1]]$Trt)
, SE = model.tables(x = fm1, type = "means", se = TRUE)$se$Trt
)
names(fm1Means1) <- c("Mean", "SE")
fm1Means2 <- data.frame(Trt = row.names(fm1Means1), fm1Means1)
fm1Means <- left_join(fm1Means2, fm1Tukey)
library(dplyr)
fm3 <-
df1 %>%
group_by(Loc) %>%
do(model = aov(Y ~ Rep + Trt , data = .))
fm3$model
library(broom)
fm3 %>% tidy(model)