So überschreiben Sie die 2GB-Speichergrenze, wenn R startet

Question

Wenn R bootet, wird das Speicherlimit (wie von memory.limit zurückgegeben) auf 2 GB festgelegt, unabhängig vom verfügbaren Arbeitsspeicher des Computers. (I found that out recently). Ich stelle mir vor, dass dieses Limit irgendwann beim Booten auf den tatsächlich verfügbaren Speicher gesetzt wird.

Dies kann durch Drucken memory.limit() in der .Rprofile-Datei gesehen werden, die beim Start bezogen wird. Es druckt "2047". Auf der anderen Seite, wenn R gebootet hat und ich memory.limit() in der Konsole tippe, bekomme ich "16289".

Ich benutze eine benutzerdefinierte .Rprofile Datei und ich muss Zugriff auf mehr als 2 GB während des Bootens haben.

Wie kann dieses Limit überschrieben werden?

Meine aktuelle Problemumgehung ist, das Limit selbst in der .Rprofile mit memory.limit(size=16289) zu setzen, aber dann muss ich dies jedes Mal bearbeiten, wenn ich auf einem Computer mit einer anderen Menge an RAM arbeite, die ziemlich oft passiert.

Gibt es eine Option, die ich ändern kann, eine .ini-Datei, die ich bearbeiten kann, oder was kann ich dagegen tun?

OS und R-Version:

> sessionInfo() 
R version 3.2.2 (2015-08-14) 
Platform: x86_64-w64-mingw32/x64 (64-bit) 
Running under: Windows 7 x64 (build 7601) Service Pack 1 

Edit: das ist kein Duplikat, zumindest kein Duplikat der vorgeschlagenen Frage. Es geht nicht darum, den verfügbaren Speicher zu verwalten! Ich habe 16GB Speicher und memory.limit() zeigt, dass mein Limit in der Tat 16GB ist.

Alles begann, als ich die Warnung erhielt, dass ich "2GB Speicherzuweisung" erreicht hatte (was bedeutet, dass ich eine Speichergrenze von 2 GB hatte). Nach der Untersuchung scheint es, dass indeed R limits the memory at 2GB during the startup process.

Ich möchte meine Daten automatisch laden, wenn R startet, dafür habe ich ein kleines Ladeskript in der .Rprofile. Ich lade mehr als 2GB Daten, also muss ich Zugang zu meinen 16GB haben. Meine Frage ist, dies zu erreichen. Dies hat gar nichts gemeinsam mit der vorgeschlagenen doppelten, mit Ausnahme Keywords ...

Answer 1

Ich Interpretation dieses, wie Sie memory.limit(size=16289) in Ihrer .RProfile Datei zu wollen, aber Sie wollen nicht auf die spezifische Nummer einzustellen jeden Zeit wechseln Sie Computer mit unterschiedlichem Speicher. Warum ziehen Sie nicht einfach den benötigten Speicher dynamisch? In den Fenstern:

TOT_MEM <- as.numeric(gsub("\r","",gsub("TotalVisibleMemorySize=","",system('wmic OS get TotalVisibleMemorySize /Value',intern=TRUE)[3])))/1024 
memory.limit(size=TOT_MEM) 

, die den verfügbaren Speicher auf den Gesamtspeicher des Systems, oder

FREE_MEM <- as.numeric(gsub("\r","",gsub("FreePhysicalMemory=","",system('wmic OS get FreePhysicalMemory /Value',intern=TRUE)[3])))/1024 
memory.limit(size=FREE_MEM) 

die memory.limit auf den gesamten verfügbaren Speicher würde eingestellt auf Boot gesetzt würde.

Platzieren Sie dies in RProfile, wo Sie Ihre Daten laden.