Hinzufügen UMLS Benutzername und Passwort zu Ctakes

Question

Ich bin ein neuer Benutzer auf CTAKES. Ich folgte dem Benutzerinstallationshandbuch und fügte UMLS-Zugriffsrechte hinzu. Nachdem ich runctakesCPE.bat und runctakesCVD.bat bearbeitet, habe ich folgendes:

F: \ Apache-ctakes-4.0.0> set CTAKES_HOME = F: \ Apache-ctakes-4.0.0

F: \ apache-ctakes-4.0.0> falls vorhanden "F: \ apache-ctakes-4.0.0 \ bin \ runctakesCVD.bat" gehe zu okHome

F: \ apache-ctakes-4.0.0> falls vorhanden "C : \ Programme \ Java \ jdk1.8.0_65 \ bin \ java.exe "set PATH = C: \ Programm Dateien \ Java \ jdk1.8.0_65 \ bin; C: \ Programme \ Java \ jdk1.8.0_65 \ bin; C: \ Programme \ Java \ jdk1.8.0_65 \ jre \ bin; C: \ Programme \ Oracle \ Java \ javapath; C: \ Programme (x86) \ Intel \ iCLS-Client \; C: \ Program Fil es \ Intel \ iCLS-Client \; C: \ WINDOWS \ system32; C: \ WINDOWS; C: \ WINDOWS \ System32 \ Wbem; C: \ WINDOWS \ System32 \ Wi ndowsPowerShell \ v1.0 \; C: \ Programme \ Intel \ Intel (R) Management Engine Komponenten \ DAL; C: \ Programme Fi les (x86) \ Intel \ Intel Management Engine Komponenten \ DAL; C: \ Programme \ Intel \ Intel (R) Management Engine Components \ IPT ; C: \ Programme (x86) \ Intel \ Intel Management Engine-Komponenten \ IPT; c: \ Pro Gramm Dateien (x86) \ Hewlett-Packard \ HP Leistungsberater; C: \ Programme \ Microsoft \ Web Platform Inst aller \; C: \ Programme (x86) \ Microsoft ASP.NET \ ASP.NET-Webseiten \ v1.0 \; C: \ Programme (x86) \ Windo WS Kits \ 8.0 \ Windows Performance Toolkit \; C: \ Programme \ Microsoft SQL Server \ 110 \ Tools \ Binn \ C: \ Pr Ogram-Dateien \ IDM-Computer-Lösungen \ UltraEdit; C: \ Python27; C: \ Programme (X 86) \ MiKTeX 2.9 \ miktex \ bi n \; C: \ Programme \ MATLAB \ R2015b \ runtime \ win64; C: \ Programme \ MATLAB \ R2015b \ bin; C: \ Programme \ IBM \ SPSS \ Statistics \ 24 \ JRE \ bin; C: \ cygwin64 \ bin; C: \ Programme (x86) \ Skype \ Phone \; C: \ Programme (x86) \ Google \ Chrome \ Anwendung; C: \ Programme \ Java \ jdk1.8.0_65 \ bin; C: \ Programme \ Java \ jdk1.8.0 _65 \ jre \ bin; C: \ Programme \ Oracle \ Java \ javapath; C: \ Programme (x86) \ Intel \ iCLS-Client \; C: \ Programm Dateien \ Intel \ iCLS-Client \; C: \ Windows \ System32; C: \ Windows; C: \ Windows \ System32 \ Wbem; C: \ Windows \ System3 2 \ WindowsPowerShell \ v1.0 \; C: \ Programme \ Intel \ Intel Management Engine-Komponenten \ DAL; C: \ Progra m Dateien (x86) \ Intel \ Intel Management Engine-Komponenten \ DAL; C: \ Programme \ Intel \ Intel (R) Verwalten Ment Engine Compo nents \ IPT; C: \ Programme (x86) \ Intel \ Intel Management Engine-Komponenten \ IPT; c: \ Programme (x86) \ Hewlett-Packard \ HP Leistungsberater; C: \ Programme \ Microsoft \ Web Platform Installationsprogramm \; C: \ Programme (x86) \ Microsoft ASP.NET \ ASP.NET-Webseiten \ v1.0 \; C: \ Programme (x86) \ W Windows \ Kits \ 8.0 \ Windows-Leistung Toolkit \; C: \ Programme \ Microsoft SQL Server \ 110 \ Tools \ Binn \; C : \ Programme \ IDM Computer Solutions \ UltraEdit; C: \ Python27; C: \ Benutzer \ yi chen \ AppData \ Local \ Programme \ Git \ cmd; C: \ Benutzer \ yi chen \ AppData \ Local \ Programme \ EmEditor

F: \ apache-ctakes-4.0.0> cd F: \ apache-ctakes-4.0.0

F: \ Apache-ctakes-4.0.0> IF "" == "" GOTO NoParam

F: \ Apache-ctakes-4.0.0> echo die GUI Verwenden Sie die AE laden Verwenden GUI wählen das wählen AE zum Laden

F: \ apache-ctakes-4.0.0> java -Dctakes.umlsbenutzer = "F: \ apache-ctakes-4.0.0 \ desc \; F: \ apache-ctakes-4.0.0 \ Ressourcen \; F: \ apache-ctakes-4.0.0 \ lib * "-Dlog4j.configuration = Datei: \ F: \ apache-ctakes-4.0.0 \ config \ l og4j.xml -Xms512M -Xmx3g org. apache.uima.tools.cvd.CVD 0-cp Das System kann die angegebene Datei nicht finden.

F: \ Apache-ctakes-4.0.0> GOTO Zurückwechsel

jemand helfen, um einen Reim kann? Ich brauche wirklich deine Hilfe. Danke!

Answer 1

Beantworten Sie diese Frage wegen Menschen, die dieses Problem in Zukunft bekommen.

@jhshi: Die Änderungen, die Sie in runCVD.bat vorgenommen haben, scheinen nicht korrekt zu sein.

Die Dokumentation erfordert, dass Sie Ihre UMLS Konto Benutzername und Passwort in jeder Bat-Datei (oder sh-Datei für liebsten Linux-Benutzer) hinzuzufügen. Das bedeutet, dass jeder CTAKES-Benutzer ein UMLS-Konto here erstellen muss.

Dies geschieht mit den Java-Befehlszeilenargumenten "-Dctakes.umlsuser" & "-Dctakes.umlspw". Schauen Sie sich meine Java-Aufrufzeile aus der runCVD.bat-Datei an.

java -Dctakes.umlsuser="gprakhar" -Dctakes.umlspw="XXXXXXX" -cp "%CTAKES_HOME%\desc\;%CTAKES_HOME%\resources\;%CTAKES_HOME%\lib\*" -Dlog4j.configuration=file:\%CTAKES_HOME%\config\log4j.xml -Xms512M -Xmx2g org.apache.uima.tools.cvd.CVD 

Sie haben den Wert einer PATH-ähnlichen Variablen an das umlsuser cmd-Zeilenargument übergeben.