Wie man distuts erklärt, gcc zu benutzen?

Question

Ich möchte ein Testprojekt, das C++ - und OpenMP-Code enthält, mit Cython umhüllen und mit distutils über eine Datei setup.py erstellen. Der Inhalt meiner Datei sieht wie folgt aus:

from distutils.core import setup 
from distutils.extension import Extension 
from Cython.Build import cythonize 
from Cython.Distutils import build_ext 


modules = [Extension("Interface", 
        ["Interface.pyx", "Parallel.cpp"], 
        language = "c++", 
        extra_compile_args=["-fopenmp"], 
        extra_link_args=["-fopenmp"])] 

for e in modules: 
    e.cython_directives = {"embedsignature" : True} 

setup(name="Interface", 
    cmdclass={"build_ext": build_ext}, 
    ext_modules=modules) 

Die -fopenmp Flagge mit gcc verwendet wird, zu kompilieren und Link gegen OpenMP. Allerdings, wenn ich rufe nur

cls ~/workspace/CythonOpenMP/src $ python3 setup.py build 

dieses Flag nicht erkannt wird, weil der Compiler Klirren ist:

running build 
running build_ext 
skipping 'Interface.cpp' Cython extension (up-to-date) 
building 'Interface' extension 
cc -Wno-unused-result -fno-common -dynamic -DNDEBUG -g -O3 -Wall -Wstrict-prototypes -I/usr/local/include -I/usr/local/opt/sqlite/include -I/usr/local/Cellar/python3/3.3.0/Frameworks/Python.framework/Versions/3.3/include/python3.3m -c Interface.cpp -o build/temp.macosx-10.8-x86_64-3.3/Interface.o -fopenmp 
clang: warning: argument unused during compilation: '-fopenmp' 
cc -Wno-unused-result -fno-common -dynamic -DNDEBUG -g -O3 -Wall -Wstrict-prototypes -I/usr/local/include -I/usr/local/opt/sqlite/include -I/usr/local/Cellar/python3/3.3.0/Frameworks/Python.framework/Versions/3.3/include/python3.3m -c Parallel.cpp -o build/temp.macosx-10.8-x86_64-3.3/Parallel.o -fopenmp 
clang: warning: argument unused during compilation: '-fopenmp' 
Parallel.cpp:24:10: warning: unknown pragma ignored [-Wunknown-pragmas] 
     #pragma omp parallel for 
       ^
1 warning generated. 
c++ -bundle -undefined dynamic_lookup -L/usr/local/lib -L/usr/local/opt/sqlite/lib build/temp.macosx-10.8-x86_64-3.3/Interface.o build/temp.macosx-10.8-x86_64-3.3/Parallel.o -o build/lib.macosx-10.8-x86_64-3.3/Interface.so -fopenmp 
ld: library not found for -lgomp 
clang: error: linker command failed with exit code 1 (use -v to see invocation) 
error: command 'c++' failed with exit status 1 

Ich habe versucht, unsucessfully gcc angeben:

cls ~/workspace/CythonOpenMP/src $ python3 setup.py build --compiler=g++-4.7 
running build 
running build_ext 
error: don't know how to compile C/C++ code on platform 'posix' with 'g++-4.7' compiler 

Wie kann Ich sage distuts, gcc zu verwenden? diese

Answer 1

Versuchen Sie, die Umgebungsvariable "CC" aus der Datei setup.py mit os.environ zu setzen.

Answer 2

Versuchen: http://mail.python.org/pipermail/distutils-sig/2002-August/002944.html

Kurz gesagt, es scheint, dass Sie versuchen sollten: python setup.py bauen --compiler = g ++ zuerst.

Answer 3

Ich habe gerade einen Blick auf die distutils Quelle, und die --compiler Option erwartet "Unix", "msvc", "Cygwin", "Mingw32", "Bcpp" oder "EMX". Es prüft den gewünschten Compilernamen, indem er die Umgebungsvariable CC überprüft. Versuchen Sie calling wie diese bauen:

CC=gcc python setup.py build 

Sie brauchen nicht CXX zu setzen, es prüft nicht dafür.

Answer 4

Nur für den Fall einige andere stehen vor dem gleichen Problem unter Windows (wo CC-Umgebungsvariable keine Auswirkungen haben würde):

• erstellen Datei „C: \ Python27 \ Lib \ distutils \ distutils.cfg "und schreiben diese innen:

Code:

[build] 
compiler = mingw32 

• alle Instanzen entfernen von" - mno-Cygwin“gcc-Option aus der Datei "C: \ Python27 \ Lib \ distutils \ cygwinccompiler.py":

Dieses:

self.set_executables(compiler='gcc -mno-cygwin -O -Wall', 
         compiler_so='gcc -mno-cygwin -mdll -O -Wall', 
         compiler_cxx='g++ -mno-cygwin -O -Wall', 
         linker_exe='gcc -mno-cygwin', 
         linker_so='%s -mno-cygwin %s %s' 
            % (self.linker_dll, shared_option, 
             entry_point)) 

Wird dies:

self.set_executables(compiler='gcc -O -Wall', 
        compiler_so='gcc -mdll -O -Wall', 
        compiler_cxx='g++ -O -Wall', 
        linker_exe='gcc', 
        linker_so='%s %s %s' 
           % (self.linker_dll, shared_option, 
            entry_point)) 

Die zweite point kann erforderlich sein, wenn Sie eine aktuelle Version von gcc verwenden, in der die veraltete Option -mno-cygwin entfernt wurde.

Hoffe, das wird auch dann helfen, wenn es nicht direkt mit den OP-realen Bedürfnissen verbunden ist (aber immer noch mit dem Titel der Frage verbunden ist ...))

Answer 5

können Sie versuchen, anaconda env zu installieren:

conda create -n py35a python=3.5 numpy scipy matplotlib pandas gcc anaconda 

bauen mit:

zsh -c ". activate py35a && gcc --version && python setup.py build_ext --inplace"