Rscript konnte die Funktion nicht finden

Question

Ich muss mehrere Skripte über die Bash-Shell mit Rscript ausführen und einige Funktionen, die ich verwende, erfordern die Funktion isGeneric. in diesem Fall jedoch am Ende der Prozess, der wie (zum Beispiel):

Error in .getLogLik() : could not 
find function "isGeneric" 
Calls: main -> dredge -> .getLik -> .getLogLik 
Execution halted 

Dies als

# in the bash shell 
echo "isGeneric('apply')" > /tmp/test.R 
Rscript /tmp/test.R 

Ergebnis folgt wiedergegeben werden kann:

Error: could not find function "isGeneric" 
Execution halted 

Wenn wir jedoch öffnen ein R Sitzung und geben Sie Folgendes ein, es funktioniert:

# in the R shell 
isGeneric('apply') 
[1] FALSE 

Wüssten Sie, woher das Problem kommt und wie Sie es beheben können?

Answer 1

Gemäß help(Rscript) lädt Rscript das Methodenpaket standardmäßig nicht, weil es zeitaufwendig ist. Also entweder Sie benötigen sie auf der Kommandozeile angeben:

Rscript --default-packages=methods file.R 

Oder library(methods) an der Spitze der Datei, die Sie aufrufen.