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Question

def PatternMatching(Pattern, Genome): 
    positions = [] # output variable  
    for i in range(len(Genome)-len(Pattern)+1):  
     if Genome[i:i+len(Pattern)] == Pattern: 
      print(i, Pattern) 
      positions.append(Genome.index(Pattern))  
    return positions 
# Now, set Text equal to the oriC of Vibrio cholerae and Pattern equal to "TGATCA" 
Pattern = "TGATCA" 
Genome="ATCAATGATCAACGTAAGCTTCTAAGCATGATCAAGGTGCTCACACAGTTTATCCACAACCTGAGTGGATGACATCAAGATAGGTCGTTGTATCTCCTTCCTCTCGTACTCTCATGACCACGGAAAGATGATCAAGAGAGGATGATTTCTTGGCCATATCGCAATGAATACTTGTGACTTGTGCTTCCAATTGACATCTTCAGCGCCATATTGCGCTGGCCAAGGTGACGGAGCGGGATTACGAAAGCATGATCATGGCTGTTGTTCTGTTTATCTTGTTTTGACTGAGACTTGTTAGGATAGACGGTTTTTCATCACTGACTAGCCAAAGCCTTACTCTGCCTGACATCGACCGTAAATTGATAATGAATTTACATGCTTCCGCGACGATTTACCTCTTGATCATCGATCCGATTGAAGATCTTCAATTGTTAATTCTCTTGCCTCGACTCATAGCCATGATGAGCTCTTGATCATGTTTCCTTAACCCTCTATTTTTTACGGAAGAATGATCAAGCTGCTGCTCTTGATCATCGTTTC"  

print(PatternMatching(Pattern, Genome)) 

Looping nur Diese Funktion return [5, 5, 5, 5, 5, 5, 5, 5], aber korrekte Ausgabe wird [5,28,128,249,399,470,509,527]

Warum erstes passend Index zurückgegeben für alle nachfolgenden Abgleich?

Answer 1

Ich habe meinen Fehler im Code gefunden. Linienpositionen.append (Genome.index (Pattern)) sollte durch positions.append (i) ersetzt werden. Das gibt das richtige Ergebnis.