So erstellen Sie eine R Markdown-Vignette mit plotly Grafiken

Question

Ich habe eine bestehende R-Paket auf CRAN (rms-Paket), für die ich eine HTML-Vignette mit R Markdown mit RStudio erstellt hinzufügen möchte. Ich sehe das meiste, was ich in den Schreiben R Extensions Handbuch und bei How to get RStudio to automatically compile R Markdown Vignettes?

brauchen Was ist nicht offensichtlich ist, dass ich plotly Funktionen verwenden möchten, interaktive Grafiken zu erstellen. Selbstständige HTML-Dateien, die dies mit RStudio verwenden, funktionieren großartig, aber ich weiß nicht, wie man sicherstellt, dass solche Vignetten mit einer CRAN-Einreichung funktionieren und wie man dies einrichtet.

Answer 1

Ich habe Folgendes versucht. Ich habe ein R-Abschriften-Dokument (test.Rmd) in RStudio erstellt und folgendes eingefügt.

## Testing interactive graphics 

```{r} 
library(highcharter) 
library(ggplot2) 

data(diamonds, economics_long, mpg, package = "ggplot2") 
hchart(mpg, "scatter", x = displ, y = hwy, group = class) 
``` 

Convert diese 'test.Rmd' auf 'test.md' und schließlich zu 'test.html', indem Sie auf die Schaltfläche Knit HTML in RStudio klicken, oder indem Sie das folgende Skript in der Konsole ausgeführt wird:

library(knitr) 
knit("test.Rmd", tangle=F, encoding = "utf-8") 
render("test.md",output_format=html_document()) 

Dies generiert eine HTML-Datei mit interaktiven Grafiken.

Ja. Dies ist nicht plotly, aber highcharter ist ein schönes R-Paket, das mehrere interaktive Javascript Plotten Bibliotheken enthält und es ist einfach zu bedienen. Es ist auch besser dokumentiert als rCharts zum Beispiel. Der Paketbetreuer ist auch freundlich und reagiert auf Anfragen. Installieren Sie highcharter Paket hier:

library(devtools) 
install_github("jbkunst/highcharter")