Gephi: Farbknoten nach einem Gewicht in einem spärlich gerichteten Graphen

Question

Ich möchte mit Gephi ein großes, spärliches Diagramm visualisieren (es sind etwa 876.000 Knoten, die das "Internet" zum Testen eines Page Rank-Algorithmus simulieren) .

Hier ist das Problem: Ich habe den Seitenrang für die Knoten in der Grafik berechnet (sie als "Websites").

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Nun, ich brauche die Daten in eine CSV so ausgeben, dass Gephi es in lesen können ... und ich möchte die Knoten nach einer Heatmap/Farbkarte färben, die ihnen eine Farbe verleiht entsprechenden zu ihrem Seitenrang.

So würde ich ein Diagramm benötigen, so dass jeder Scheitelpunkt ein Gewicht erhält, und dann den Graphen entsprechend einfärben.

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Brand new zu Gephi, und ich bin auf den website: es wird beschrieben, wie Kantengewichte in dem Adjazenzmatrix-Format speichern, aber mein Graph ist viel zu groß als Adjazenzmatrix zu speichern. Wenn ich es als Adjazenzliste, speichere, sehe ich keine Möglichkeit, entweder ein Kantengewicht oder ein Knotengewicht zu speichern. Das Format, in dem Link beschrieben:

> a;b;c;d 

Damit erzielt:. "A-> d" Knoten "A" mit "a-> b", "a-> c" und Es scheint jedoch keinen Schlitz in dem Format für ein Knotengewicht oder ein Kantengewicht zu geben.

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Ist es möglich, Gephi zu verwenden, um ein Diagramm anzuzeigen, die ich beschrieben habe - mit den Knoten auf ihr Gewicht farbig nach - und wenn ja, wie würde ich die Grafik speichern für Gephi zu lesen ?

Answer 1

Ich denke, die Seite, auf die Sie sich beziehen, könnte veraltet sein. Unter this page erwähnen sie zwei Arten von CSV: Edge vs. Node-Tabellen.

So konnten Sie zwei verschiedene CSV-Dateien erzeugen:

• Ein Kantentabelle Knotenpaare enthält, zu Verbindungen entsprechen, vielleicht Gewichte, wenn Sie welche haben.
• Eine Knotentabelle mit der Liste der Knoten in Ihrem Diagramm und den Attributen, die sie haben, einschließlich Ihres PageRank-Werts.