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Ich habe 24 Paare dieser Dateien (24 Dateien output.chr1 to 24_.vcf.gz
und 24 Dateien Analysis.chr1 to 24_.output.vcf.gz
). Ich versuche, diese entsprechenden Paare zusammenzuführen, um merged_file_.chr1 to 24_.vcf.gz
Dateien zu erstellen. Wie kann ich eine solche Schleife im Bash-Skript bilden, um diesen folgenden Befehl zu verwenden?Bash-Schleife zum Erstellen indexierter zusammengeführter Dateien
vcf-merge output.chr1.vcf.gz Analysis.chr1.output.vcf.gz | \
bgzip -c > ../dir_destination/merged_file_.chr1.vcf.gz