2016-04-25 5 views
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Ich habe ein Objekt der Klasse "summary.coxph"Extract Zusammenfassung Wirkung von Objekt der Klasse "summary.coxph"

Fixed-effects meta-analysis 
Call: meta.summaries(d = A[[i]]$hr, se = A[[i]]$se, method = c("fixed"), 
    names = A[[i]]$metabolite, conf.level = 0.95) 
Summary effect=1.09 95% CI (1.05, 1.13) 
Estimated heterogeneity variance: 0 p= 0.398 

I Summary effect, 95%CI und p extrahieren müssen. Aber alle meine Versuche scheiterten. Kannst du mir bitte Helfen.

Meine Daten sieht wie folgt aus:

$    :List of 14 
    ..$ effects  : num [1:3] 1.07 1.07 1.14 
    ..$ stderrs  : num [1:3] 0.0298 0.0421 0.0436 
    ..$ summary  : num 1.09 
    ..$ se.summary  : num 0.0213 
    ..$ test   : num [1:2] 51.2 0 
    ..$ het   : num [1:3] 1.841 2 0.398 
    ..$ call   : language meta.summaries(d = A[[i]]$hr, se = A[[i]]$se, method = c("fixed"), names = A[[i]]$metabolite, conf.level = 0.95) 
    ..$ names   : chr [1:3] "XXL.VLDL.TG" "XXL.VLDL.TG" "XXL.VLDL.TG" 
    ..$ tau2   : num 0 
    ..$ variance.method: chr "fixed" 
    ..$ weights  : num [1:3] 1124 563 525 
    ..$ weight.method : chr "fixed" 
    ..$ conf.level  : num 0.95 
    ..$ logscale  : logi FALSE 
    ..- attr(*, "class")= chr "meta.summaries" 
- attr(*, "class")= chr "summary.coxph" 

Sie für jede Hilfe danken.

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betrachten Sie die letzten Zeilen von 'rmeta :: print.meta.summaries' – rawr

Antwort

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Nach @ rawr Kommentar, finden Sie:

Bei einem summary.coxph Objekt x verwenden x$het[3] für den p-Wert, x$summary für die Zusammenfassung Wirkung und x$summary + qnorm(c(0.025, 0.975)) * x$se.summary für die 95% CI.