knitr Ausführung R Code Chunks in HTML-Stil kommentiert

Question

Mit Rstudio eine Rmarkdown Datei zu bearbeiten, verwende ich HTML-Kommentare große Blöcke markieren, die ich will nicht verarbeitet haben oder in der Ausgabe. Das funktioniert gut in Rstudio, das alles in den Kommentaren ignoriert. Wenn ich jedoch Rstudio anflehe, das Dokument zu stricken, führt knitr die R Codeblöcke in den Kommentaren aus.

Hier ist eine MWE .Rmd Datei:

# Important stuff I want to see 
This is what I want to see: 
```{r} 
pi # I like pi 
``` 
<!--- 
**This section commented out, as not ready to be knit yet** 
This is what I do not want to see: 
```{r} 
cake # I also like cake, but it's undefined 
``` 
--> 

Dies bewirkt, dass knitr scheitern mit Error in eval(expr, envir, enclos) : object 'cake' not found ... Execution halted

Gibt es eine einfache Möglichkeit, ganze Schwaden von einer Rmarkdown Datei auszukommen, die die R von der Ausführung knitr verhindert Code Brocken in den Kommentaren?

Ich habe global comment option for R markdown in knitr und Comments in Markdown, sowie https://yihui.name/knitr/ betrachtet, aber habe keine Lösung gefunden.

Answer 1

Wählen Sie die Zeilen vor und nach dem {r} Code-Chunk und verwenden Sie Control/Shift-C (pc) zum Auskommentieren. Du wirst diese Art von Syntax bekommen; Es wird nicht gestrickt und gibt keinen Fehler.

<!-- **This section commented out, as not ready to be knit yet** --> 
<!-- This is what I do not want to see: --> 
<!-- ```{r} --> 
<!-- cake # I also like cake, but it's undefined --> 
<!-- ``` --> 

Answer 2

Im zweiten Code Junk könnten Sie eval=F gesetzt, bis Sie diesen Teil des Codes beendet haben.

<!-- 
**This section commented out, as not ready to be knit yet** 
This is what I do not want to see: 
```{r eval=F} 
cake # I also like cake, but it's undefined 
``` 
--> 

Answer 3

Idee Unter jburkhardt eval=F zu verwenden, funktioniert dies als einen Weg Block Kommentare zu tun, wo knitr nicht die R Codeblöcke ausführt:

Stuff I want to see... 
```{r} 
pi 
``` 

<!-- 
This is added at the beginning of the comment: 
```{r, include=FALSE} 
knitr::opts_chunk$set(eval= FALSE) 
``` 

Stuff I have commented out: 

```{r} 
cake 
``` 

This is added to the end of the comment: 
```{r, include=FALSE, eval=TRUE} 
knitr::opts_chunk$set(eval= TRUE) 
``` 
--> 

More stuff I want to see: 
```{r} 
2*pi 
``` 

Es ist ein bisschen klobig, und es ist sicherlich nicht kugelsicher (Zum Beispiel, knitr wird immer noch alle Code-Blöcke laufen, die es mit expliziten eval=true findet), aber es funktioniert in meinem Fall.