Was ist der beste Weg, um einen ergänzenden Charakter der DNA mit Listenverständnis ohne 4 verschiedene if Aussagen zurückzugeben?Geben Sie einen ergänzenden Nukleotid-Zeichen zurück
Zum Beispiel:
A <-> T "A" zurückkehrt "T" und "T" gibt "A"
G <-> C "G" gibt "C" und "C" zurückkehrt "G"
Ohne Schleifen oder dergleichen. Eingebaute Funktionen sind erlaubt.
Können Sie haben externe Wörterbuch wie dieses
strand = 'GATTAGAC'
comps = {'A':'T', 'C':'G', 'G':'C', 'T':'A' }
comp_strand = [ comps[x] for x in strand ]
Wenn Sie unbekannte Zeichen in Ihrem Eingang, nachschlagen 'defaultdict'
Nur ein kleiner Syntaxfehler, das Eröffnungsanführungszeichen für ' A 'fehlt die Zuweisung von Comps – coolioasjulio
eine andere Antwort von hier http://biopython.org/wiki/Seq
>>> from Bio.Seq import Seq
>>> from Bio.Alphabet import generic_dna
>>> my_dna = Seq("AGTACACTGGT", generic_dna)
>>> my_dna
Seq('AGTACACTGGT', DNAAlphabet())
>>> my_dna.complement()
Seq('TCATGTGACCA', DNAAlphabet())
>>> my_dna.reverse_complement()
Seq('ACCAGTGTACT', DNAAlphabet())
tolerieren wollen Wie über das Erstellen eines Wörterbuchs, das A bis T usw. abbildet und dann einfach im Wörterbuch nachschlägt? Es ist eine elegantere Version von if :) – okaram
@Carcigenicate der Punkt ist, dass ich 4 If-Anweisungen ausprobiert habe und möchte wissen, ob jemand einen besseren Weg hat, es zu tun –