Ich arbeite an einem Windows 7 8GB RAM.sklearn kneighbours Speicherfehler python
Dies ist vectorizer ich frei, eine Textspalte in meiner 52MB Trainingsdatenmenge
vec = CountVectorizer(analyzer='word',stop_words='english',decode_error='ignore',binary=True)
Ich mag berechnen 5 nächste Nachbarn mit diesem Datensatz für eine 18MB Testset vektorisiert verwenden.
nbrs = NearestNeighbors(n_neighbors=5).fit(vec.transform(data['clean_sum']))
vectors = vec.transform(data_test['clean_sum'])
distances,indices = nbrs.kneighbors(vectors)
Dies ist der Stack-Trace -
Traceback (most recent call last):
File "cr_nearness.py", line 224, in <module>
distances,indices = nbrs.kneighbors(vectors)
File "C:\Anaconda2\lib\site-packages\sklearn\neighbors\base.py", line 371,
kneighbors
n_jobs=n_jobs, squared=True)
File "C:\Anaconda2\lib\site-packages\sklearn\metrics\pairwise.py", line 12
in pairwise_distances
return _parallel_pairwise(X, Y, func, n_jobs, **kwds)
File "C:\Anaconda2\lib\site-packages\sklearn\metrics\pairwise.py", line 10
in _parallel_pairwise
return func(X, Y, **kwds)
File "C:\Anaconda2\lib\site-packages\sklearn\metrics\pairwise.py", line 23
n euclidean_distances
distances = safe_sparse_dot(X, Y.T, dense_output=True)
File "C:\Anaconda2\lib\site-packages\sklearn\utils\extmath.py", line 181,
afe_sparse_dot
ret = ret.toarray()
File "C:\Anaconda2\lib\site-packages\scipy\sparse\compressed.py", line 940
toarray
return self.tocoo(copy=False).toarray(order=order, out=out)
File "C:\Anaconda2\lib\site-packages\scipy\sparse\coo.py", line 250, in to
y
B = self._process_toarray_args(order, out)
File "C:\Anaconda2\lib\site-packages\scipy\sparse\base.py", line 817, in _
ess_toarray_args
return np.zeros(self.shape, dtype=self.dtype, order=order)
MemoryError
Irgendwelche Ideen?
Verwenden Sie 32-Bit Python oder 64-Bit Python? Der Wechsel zu 64-Bit kann dieses Problem beheben. – probitaille
Ich benutze 64 Bit in der Tat ... –
Hum ... wenn Sie die Anzahl der Nachbarn (n_neighbors) senken, haben Sie das gleiche Problem? Ich mache eigentlich etwas ähnliches, aber mit viel mehr Daten und mit mehreren n_neighbors in einer Schleife (wie 1 bis 9). Ich habe einen Speicherfehler bekommen, indem ich Python 32 Bit benutzt habe und ich habe zu Anaconda 64 Bit gewechselt und das hat mein Problem gelöst. – probitaille