2017-10-03 3 views
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ich einige Dateien zusammen bin setzen mit dem folgenden Code:Woher weiß ich, welche Pakete die anderen stören?

data_path <- "daymet" 
files <- dir(data_path, pattern = "*.csv") 

daymet <- data_frame(filename = files) %>% 
    mutate(file_contents = map(filename, ~ read_csv(file.path(data_path, .), 
    skip=7)))%>% 
    unnest()%>% 
    mutate(site = str_sub(filename, 1, 3)) 

Anfangs hatte ich einige Probleme mit dem Fehler „‚GAJPCSR1_2003_2011.csvMapEnv‘ist kein exportierte Objekt von‚Namespace: Karten‘“. Ich habe purrr neu installiert. Fehler weg, alles hat funktioniert!

Ich ging, um dies mit dem Rest meiner Analyse zurückzulegen, löschte meine Umgebung, und als R zu diesem Brocken kam, kam die gleiche Fehlermeldung zurück.

Ich habe alle diese anderen Pakete gehen, so scheint es wie einer von ihnen funktioniert nicht gut mit purrr. Oder vielleicht nicht. Auch wenn ich nicht alle Pakete lade, bekomme ich immer noch die gleiche Fehlermeldung.

Session Info:

R version 3.3.2 (2016-10-31) 
Platform: x86_64-w64-mingw32/x64 (64-bit) 
Running under: Windows >= 8 x64 (build 9200) 

locale: 
[1] LC_COLLATE=English_United States.1252 LC_CTYPE=English_United States.1252 
[3] LC_MONETARY=English_United States.1252 LC_NUMERIC=C       
[5] LC_TIME=English_United States.1252  

attached base packages: 
[1] stats  graphics grDevices utils  datasets methods base  

other attached packages: 
[1] reprex_0.1.1 mapdata_2.2-6 maps_3.2.0  ggmap_2.6.1  soilDB_1.8.5 aqp_1.10  
[7] stringr_1.1.0 modelr_0.1.0 lubridate_1.6.0 dplyr_0.5.0  purrr_0.2.3  readr_1.0.0  
[13] tidyr_0.6.1  tibble_1.2  ggplot2_2.2.1 tidyverse_1.1.1 

loaded via a namespace (and not attached): 
[1] httr_1.2.1   jsonlite_1.5  splines_3.3.2  Formula_1.2-1  
[5] assertthat_0.2.0 sp_1.2-5   latticeExtra_0.6-28 backports_1.0.5  
[9] lattice_0.20-34  digest_0.6.12  RColorBrewer_1.1-2 checkmate_1.8.2  
[13] rvest_0.3.2   colorspace_1.3-2 htmltools_0.3.5  Matrix_1.2-7.1  
[17] plyr_1.8.4   psych_1.6.12  devtools_1.12.0  clipr_0.3.3   
[21] XML_3.98-1.8  broom_0.4.2   raster_2.5-8  haven_1.0.0   
[25] scales_0.4.1  whisker_0.3-2  jpeg_0.1-8   htmlTable_1.9  
[29] withr_1.0.2   nnet_7.3-12   lazyeval_0.2.0  mnormt_1.5-5  
[33] proto_1.0.0   survival_2.41-3  magrittr_1.5  readxl_0.1.1  
[37] evaluate_0.10  memoise_1.0.0  nlme_3.1-131  MASS_7.3-45   
[41] forcats_0.2.0  xml2_1.1.1   foreign_0.8-67  tools_3.3.2   
[45] data.table_1.10.4 hms_0.3    geosphere_1.5-5  RgoogleMaps_1.4.1 
[49] munsell_0.4.3  cluster_2.0.5  plotrix_3.6-4  callr_1.0.0   
[53] rlang_0.1.2   grid_3.3.2   rjson_0.2.15  htmlwidgets_0.8  
[57] rmarkdown_1.5  labeling_0.3  base64enc_0.1-3  gtable_0.2.0  
[61] DBI_0.5-1   reshape_0.8.6  reshape2_1.4.2  R6_2.2.0   
[65] gridExtra_2.2.1  knitr_1.17   rprojroot_1.2  Hmisc_4.0-3   
[69] stringi_1.1.2  parallel_3.3.2  Rcpp_0.12.10  mapproj_1.2-4  
[73] rpart_4.1-10  acepack_1.4.1  png_0.1-7   
+0

Vielleicht die Ausgabe von 'Session()' enthalten? – Jaap

+0

Überprüfen Sie 'conflicts()', um zu sehen, ob Variablen in zwei verschiedenen Umgebungen definiert sind. – MrFlick

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Meine Vermutung ist, dass sowohl die 'maps' als auch die' purrr' Pakete eine Funktion namens 'map()' haben. Sie müssen vorsichtig sein, wenn Sie diese laden - der letzte ist der Standard, den Sie bekommen. Verwenden Sie die vollständigen Namen, um 'maps :: map()' oder 'purrr: map()' – MrFlick

Antwort

2

Sie alles sehen können, die maskiert Maskieren oder wird mit

conflicts(detail = TRUE) 

Zum Beispiel in meinem aktuellen R-Sitzung können Sie unten sehen, dass ich zu beantworten habe Fragen zu SO wegen aller generischen Datennamen in der globalen Umgebung, df, dt und t Maskierung der Basisfunktionen mit dem gleichen Namen. Und Sie können Datentafel des first und last sehen die dplyr Versionen Maskierung, weil ich data.table nach dplyr geladen:

> conflicts(detail = T) 
$.GlobalEnv 
[1] "n"  "df" "dt" "gamma" "t"  

$`package:stringr` 
[1] "%>%" 

$`package:data.table` 
[1] "between" "first" "last" 

$`package:dplyr` 
[1] "%>%"  "between" "first"  "last"  "n"   "filter" "lag"  
[8] "intersect" "setdiff" "setequal" "union"  

$`package:ggplot2` 
[1] "Position" 

$`package:stats` 
[1] "df"  "dt"  "filter" "lag" 

$`package:methods` 
[1] "body<-" "kronecker" 

$`package:base` 
[1] "body<-" "gamma"  "intersect" "kronecker" "Position" "setdiff" "setequal" 
[8] "t"   "union"  
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