devtools installieren github Ignorieren bestimmter. RDA-Dateien

Question

Ich teste gerade meine R-Paket, das zwei .rda Dateien in der Ordner, die here gefunden werden kann. Sie wurden mit dem Befehl devtools::use_data erstellt. Sie sind keine sehr großen Dateien, die größte ist 713 KB. Ich versuche, mein Paket von GitHub mit devtools zu installieren:

devtools::install.github('sahirbhatnagar/manhattanly') 

Aber aus irgendeinem Grunde nur eine der beiden .rda Dateien installiert wird (die hapmap.rda Datei installiert doesnt erhalten):

devtools::install_github('sahirbhatnagar/manhattanly', force = TRUE, build_vignette = TRUE) 
Downloading GitHub repo sahirbhatnagar/manhattanly@master 
from URL https://api.github.com/repos/sahirbhatnagar/manhattanly/zipball/master 
Installing manhattanly 
'/usr/lib64/R/bin/R' --no-site-file --no-environ --no-save --no-restore CMD build \ 
    '/tmp/RtmpEYJ9AG/devtools84183fc48b7d/sahirbhatnagar-manhattanly-0dead52' --no-resave-data --no-manual 

* checking for file ‘/tmp/RtmpEYJ9AG/devtools84183fc48b7d/sahirbhatnagar-manhattanly-0dead52/DESCRIPTION’ ... OK 
* preparing ‘manhattanly’: 
* checking DESCRIPTION meta-information ... OK 
* installing the package to build vignettes 
* creating vignettes ... OK 
* checking for LF line-endings in source and make files 
* checking for empty or unneeded directories 
* looking to see if a ‘data/datalist’ file should be added 
* building ‘manhattanly_0.1.0.tar.gz’ 

'/usr/lib64/R/bin/R' --no-site-file --no-environ --no-save --no-restore CMD INSTALL '/tmp/RtmpEYJ9AG/manhattanly_0.1.0.tar.gz' \ 
    --library='/mnt/GREENWOOD_BACKUP/home/sahir.bhatnagar/Rlibs/R3.2.2' --install-tests 

* installing *source* package ‘manhattanly’ ... 
** R 
** data 
*** moving datasets to lazyload DB 
** inst 
** preparing package for lazy loading 
Note: the specification for S3 class “AsIs” in package ‘DBI’ seems equivalent to one from package ‘jsonlite’: not turning on duplicate class definitions for this class. 
** help 
*** installing help indices 
    converting help for package ‘manhattanly’ 
    finding HTML links ... done 
    manhattanly        html 

    finding level-2 HTML links ... done 

    manhattanr        html 
    qqly         html 
    qqr          html 
    significantSNP       html 
** building package indices 
** installing vignettes 
** testing if installed package can be loaded 
Note: the specification for S3 class “AsIs” in package ‘DBI’ seems equivalent to one from package ‘jsonlite’: not turning on duplicate class definitions for this class. 
* DONE (manhattanly) 

Wenn Ich versuche, das Paket mit devtools::check() zu überprüfen Ich bekomme auch einen Fehler beim Versuch, die Vignette zu bauen, sagen, dass das hapmap Objekt wurde nicht gefunden.

Eine Idee, warum das passiert? Die .csv file ist nicht so groß entweder ~ 2.2 Mb

Answer 1

Ihre .Rbuildignore Datei eine Zeile hat:

hapmap.R 

Da diese als reguläre Ausdrücke behandelt werden, sind Sie R erzählt die hapmap.rds Datei zu ignorieren, welches auch das Regex-Muster entspricht. Aktualisieren Sie das einfach mit einem $ oder setzen Sie den Verzeichnisnamen vor, um die Regex zu begrenzen.