Mittelwert von 3 Zeilen in der Matrix

Question

Ich habe eine Matrix aus folgendem Aufbau:

d <- read.table(text='Sample  Target Value 
Sample1 A   NA 
Sample1 A   2 
Sample1 A   3 
Sample2 A   1 
Sample2 A   2 
Sample2 A   3 
Sample1 B   1 
Sample1 B   2 
Sample1 B   3 
Sample2 B   NA 
Sample2 B   2 
Sample2 B   3', header=TRUE) 

Ich mag würde die Mittel der Value Spalte für jede Datenwiederholung nehmen. Also der Durchschnitt aller Zeilen, die haben Sample=Sample1 und Target=A, Sample=Sample2 und Target=B und so weiter und so fort.

sollte die Ausgabe eine Matrix so aussehen:

result <- read.table(text='Sample  Target Value 
Sample1 A   mean 
Sample2 A   mean 
Sample1 B   mean 
Sample2 B   mean' , header=TRUE) 

ich mit aggregate() dieses Problem zu lösen versucht, aber ich bin nicht sicher, wie es zu codieren, so dass es die Sample und Target Spalten und mißachten bewahrt die NA

Vielen Dank!

Answer 1

Ich denke, aggregate ist in diesem Fall in Ordnung. Versuchen:

aggregate(d$Value, list(d$Sample, d$Target), mean, na.rm = TRUE) 
    Group.1 Group.2 x 
1 Sample1  A 2.5 
2 Sample2  A 2.0 
3 Sample1  B 2.0 
4 Sample2  B 2.5