rentrez

1Hitze

2Antwort

Berechnung der Anzahl von xmlchildren unter jedem Elternknoten für eine Liste in R

Das ist irgendwie langatmig, also bitte bare mit mir. Ich frage PubMED mit einer langen Liste von PMIDs mit R. Da enrez_fetch nur eine bestimmte Anzahl auf einmal tun kann, habe ich meine ~ 2000 PMIDs

1Hitze

1Antwort

Wie zu verfolgen, welche Protein-ID mit welcher Gen-ID mit Rentrez verbunden ist

Ich habe eine Reihe von Protein-IDs und ich möchte die entsprechenden codierenden Sequenzen (CDS) holen, ohne die Protein-ID zu verlieren. Ich habe es geschafft, die entsprechenden CDS herunterzuladen

0Hitze

1Antwort

Speichern von Daten im Datenrahmen von for-Schleife - rentrez

Ich versuche, eine Liste von SNPs zu finden, die PubMed Einträge mit dem rentrez Paket haben. Wenn ich den folgenden Code ausführe, habe ich einen NULL-Datenrahmen. Ich denke, ich schreibe den Datenra

1Hitze

2Antwort

Verwenden von riverrez zum Aussortieren von Autor und Zugehörigkeit von pubmed

Mein übergeordnetes Ziel ist es, ein Co-Autor Netzwerk-Diagramm zu erstellen. Ich habe eine Liste von PubMed-IDs und diese sind die einzigen Publikationen, an denen ich mich für die grafische Darstell