Conda Aktivieren/Deaktivieren der Umgebung brechen PATH

Question

Ich finde, dass, wenn ich eine Conda-Umgebung source activate environment erstellen und deaktivieren Sie diese Umgebung source deactivate environment, meine native Bash-Befehle nicht mehr funktionieren.

Ich habe ein Bild von ls angebracht, bevor Sie eine Umgebung aktivieren und dann nicht danach. Ich nehme an, dass das etwas an meinem PATH ist - aber ich bin ein Neuling und bin mir nicht sicher, was genau zu beheben ist. Ich mache das in Git Bash unter Windows. Anakonda 3 und Python 3.5.

Please work ls, come on

Answer 1

Wahrscheinlich Ihre Conda Umgebung der Parameter und Umgebungsvariablen in Ihrem lokalen bash Profil definiert ersetzt. Ich bin sicher, wenn Sie eine neue Umgebung (Bash-Sitzung) öffnen, werden Sie feststellen, dass alles gut funktioniert.

Ich würde vorschlagen, Sie fügen einen Befehl zum Neuladen Bash-Profil nach dem Deaktivieren der Umgebung, so dass die Profilvariablen Werte wieder angewendet werden. Es sollte das Problem lösen.

Answer 2

Ich benutze Git Bash in Windows 10 und stieß auf das gleiche Problem. Die vorherige Antwort funktioniert nicht für mich, wahrscheinlich weil ich keinen Pfad in ~/.bash_profile und ~/.bashrc gesetzt habe.

überprüfte ich meine Pfadvariablen in einem frischen git bash, es sieht aus wie:

/c/Users/chen_x/bin:/mingw64/bin:/usr/local/bin:/usr/bin:/bin:/mingw64/bin:/usr/bin:/c/Users/chen_x/bin....(more)

Nach . C:/Users/chen_x/Miniconda3/Scripts/activate C:/Users/chen_x/Miniconda3 und . activate snowflakes wird der Weg:

/C/Users/chen_x/Miniconda3/envs/snowflakes:(blalbla..):C:\Users\chen_x\Miniconda3\Library\bin;C:\Users\chen_x\Miniconda3;....(more)

ich, dass git bash davon ausgehen, nicht erkennt, Pfade wie C:\program files..., dann die folgende Zeile zu C:/Users/chen_x/Miniconda3/Scripts/activate direkt nach dem letzten EXPORT PATH= Befehl hinzugefügt (etwa Zeile 78):

export PATH="$($_CONDA_PYTHON -c "import re; p=re.sub(r'\\\', r'/', r'$PATH'); p=re.sub('(;|:)([A-Z]):', lambda m: ':/'+m.group(2).lower(), p); print(p)")" 

Es funktioniert.

By the way, erstelle ich eine ~/condaenv Skript Conda Umgebung zu starten:

#!/bin/bash 
. C:/Users/chen_x/Miniconda3/Scripts/activate C:/Users/chen_x/Miniconda3 

Es wäre zu convinent:

. ~/condaenv 
. activate snowflakes 

Answer 3

Es gibt ein paar Fehler in der aktivieren/deaktivieren Skripte, die ich in Versionen, die ich activate.cygwin und deactivate.cygwin nennen, behoben habe.

• activate.cygwin: fixe 2 Stellen, wo der Befehl Conda eine Zeichenfolge mit einer Rückkehr "\ r" am Ende zurückgibt, der die Verarbeitung confounds.

• deactivate.cygwin: Fixes Umwandlung von/cygdrive/... Fehler CondaValueError zu vermeiden: Es konnte keine Umgebung finden:/cygdrivec: \ Benutzer \ RJP \ Anaconda2 \ ENVs ...

Ich habe die modifizierten Skripte an https://bitbucket.org/snippets/plevin/ gepostet. Siehe Anweisungen oben auf activate.cygwin.