Installation der RODBC auf OS X Yosemite

Wenn das R-Paket RODBC in RStudio auf OS X Yosemite installieren, erhalte ich folgende Fehlermeldung:Installation der RODBC auf OS X Yosemite

configure: error: "ODBC headers sql.h and sqlext.h not found"

Dies ist ein häufiger Fehler und zeigt an, dass ODBC-Treiber nicht haben installiert (iODBC-Header sind in OS 10.9 nicht enthalten, daher ist die separate Installation erforderlich). Also installiere ich unixODBC und bestätige, dass die Header-Dateien im PATH vorhanden sind.

Sys.getenv("PATH") gibt mir den richtigen Pfad einschließlich, wo die beiden Dateien gefunden werden.

Wenn ich jedoch install.packages("RODBC",type = "source") erneut versuchen, bleibt derselbe Fehler bestehen. Habe das sowohl mit iODBC als auch mit unixODBC getestet.

Gibt es weitere Tests, die ich durchführen kann, um das Problem zu diagnostizieren?

Quelle

2015-01-22 Carl

Haben Sie versucht, dem Rat von [hier] (http://stackoverflow.com/a/26219189/324364) zu folgen? – joran

Absolut versucht, dass. Die erforderlichen Header-Dateien sind vorhanden und im PATH. Nur, wenn RStudio RODBC erstellt, kann es sie nicht finden. – Carl

Haben Sie versucht, die Dateien selbst zu verschieben, anstatt einfach den Pfad festzulegen? – joran

Wir haben eine Reihe von Yosemite-Systemen mit R 3.1.2, die alle mit den Xcode-Befehlszeilentools Xcode & auf dem neuesten Stand sind. Die folgend konsequent arbeitet mit jedem größeren R-Update oder neuem System installieren (am Terminal):

brew update && brew install unixODBC && \ 
    wget "http://cran.r-project.org/src/contrib/RODBC_1.3-10.tar.gz" && \ 
    R CMD INSTALL RODBC_1.3-10.tar.gz

Es (natürlich) erfordert Homebrew, aber das ist, was wir in unserem Shop standardisierten auf.

Wenn RODBC aktualisiert wird, ändert sich die Versionsnummer (1.3-10, 1.3-11, ...). Die aktuelle Version finden Sie unter https://cran.r-project.org/web/packages/RODBC/index.html.

Quelle

2015-03-23 15:47:40 hrbrmstr

Ich glaube, dass Sie ein bestätigter Benutzer von brew sind und sogar R damit kompilieren. Haben Sie eine Idee, ob das für diejenigen funktioniert, die die CRAN R-Binärdateien und die Tools von r.att.research.com verwenden? –

es jetzt Version 1.3-13 – williamsurles

Und für einige von, müssen wir "brew install wget" vor der Verwendung dieser. – Ben

bekam ich ein 404 wenn RODBC_1.3-10.tar.gz Aufruf so machte ich eine winzige Änderung oben auf das Skript und es funktionierte perfekt: Gebräu Update & & Gebräu unixODBC & & wget „http://cran.r-project.org/src/contrib/RODBC_1.3-11.tar.gz“ installieren & & R CMD INSTALL RODBC_1.3-11.tar.gz

Quelle

2015-06-16 07:07:44 itdnext

und jetzt ist es Version 1.3-12 ... – PeterK

und jetzt ist es Version 1.3-14 – Abe

Ich verwende OS X Yosemite 10.10.5, R-Version 3.2.2. Indem ich die folgenden Schritte befolge, kann ich es zum Laufen bringen.

brew install unixodbc
brew link unixodbc 3,3 (wenn Sie diesen Schritt fehlt, R kann immer noch nicht, dass diese Header-Dateien finden)
install.packages('RODBC', type='source')

Quelle

2016-06-23 13:55:40

Auf meinem OS X Yosemite-System mit unixODBC installiert von MacPorts und R .2, install.packages() gescheitert (ob von Repo oder von einem Tarball, den ich lokal gespeichert hatte), aber R CMD INSTALL RODBC_1.3-14.tar.gz hat den Job gemacht.

Quelle

2016-11-09 14:55:48 Gabi

Installation der RODBC auf OS X Yosemite

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