Wie suche ich ein Muster mit den Leerzeichen in awk?

Question

Ich möchte ein Muster suchen, das ein bisschen komplex ist, ich habe bereits gelernt, dass ich \ | angeben muss anstelle von | im Skript, aber wie schließe ich den Leerraum ein, um genau diesem Muster zu entsprechen.

TR40663|c0_g1_i2|m.33339 TR40663|c0_g1_i2|g.33339 ORF TR40663|c0_g1_i2|g.33339 TR40663|c0_g1_i2|m.33339 type:5prime_partial len:1730 (+) TR40663\|c0_g1_i2:3-5192(+) [specie] 

Ich habe diesen Code zu verwenden, die eine Sequenz mit den Mustern

awk 'BEGIN{RS=">";FS="\n"}NR>1{if ($1~/pattern) print ">"$0}' file 

Ich weiß nicht, ob die ~/ist auch mit dem Code durcheinander verwandt abruft. Später werde ich eine Liste von Elementen in mehreren Dateien übergeben, aber jetzt möchte ich zuerst dieses Muster/diese Suche überprüfen.

Danke für die Hilfe

Answer 1

~/ ist kein Operator. ~ ist der Regexp-Comparsion-Operator und /.../ sind die statischen Regexp-Trennzeichen. Befreien Sie sich von / von ~/, da ich sicher bin, dass der Syntaxfehler Sie bereits dazu auffordert.

Die Syntax für dymamic regexps Verwendung ist:

awk -v re='foo \\| bar' '$0 ~ re' file 

oder:

awk -v re='foo [|] bar' '$0 ~ re' file 

niemals das Wort pattern, verwenden btw, wie es mehrdeutig und irreführend ist. In awk sollten Sie immer die Wörter regexp oder string verwenden, während die Shell globbing patterns verwendet, die in Funktionalität und Syntax ähnlich wie regexps sind, aber in der Semantik sehr unterschiedlich sind.

Answer 2

wenn pattern eine awk Variable, die eine Zeichenfolge, die den regulären Ausdruck hält, dann muss man schreiben

if ($1 ~ pattern) 

mit kein zerschneidet.

wenn pattern nur ein Platzhalter in Ihrer Frage für die eigentliche Regex ist, dann sind Sie nicht die Endung Strich:

if ($1 ~ /pattern\|goes\|here/) 

Hinweise:

• ~/ ist kein awk Betreiber
• der Regex-Operator ist ~
• Literal Regex Muster sind mit Schrägstrichen eingeschlossen : /foo.*bar/