Wie man nicht-gierige Übereinstimmung in Ausdruck

Question

ich benutze bash. Ich habe alles versucht, was ich konnte. Es funktioniert immer in Regexr. Es funktioniert für andere Dateien. Für eine Datei funktioniert es einfach nicht, egal was passiert. Ich kann ? nicht verwenden, um einen Quantifizierer faul zu machen. Ich kann die dbsnp-Datei nicht isolieren. Bitte hilf mir!

vcfs=$(find . -type f -name "*\.vcf" -printf "%f\n") 

echo "$vcfs" 

>1000G_omni2.5.b37.vcf 

>1000G_phase1.indels.b37.vcf 

>1000G_phase1.snps.high_confidence.b37.vcf 

>dbsnp_138.b37.vcf 

>hapmap_3.3.b37.vcf 

>Mills_and_1000G_gold_standard.indels.b37.vcf 

thousandG=`expr "$vcfs" : '.*\(1000G_phase1.indels[^\n]*\.vcf\)'` 

echo $thousand 

>1000G_phase1.indels.b37.vcf 

GoldStandard=`expr "$vcfs" : '.*\(Mills_and_1000G_gold_standard.indels[^\n]*\.vcf\)'` 

echo $GoldStandard 

>Mills_and_1000G_gold_standard.indels.b37.vcf 

dbsnp=`expr "$vcfs" : '.*\(dbsnp_[1-9][3-9][3-9][^\n]*\.vcf\)'` 

echo $dbsnp 

>dbsnp_138.b37.vcf 

>hapmap_3.3.b37.vcf 

dbsnp=`expr "$vcfs" : '.*\(dbsnp_[1-9][3-9][3-9][^\n]*?\.vcf\)'` 

echo $dbsnp 

> 

dbsnp=`expr "$vcfs" : '.*\(dbsnp_[1-9][3-9][3-9].*?\.vcf\)'` 

echo $dbsnp 

> 

echo `expr "$vcfs" : '.*\(hapmap_[\n]*\.vcf\)'` 

>hapmap_3.3.b37.vcf 

Answer 1

Von Manpage von expr:

STRING: REGEX Musterabgleich durchführen. Die Argumente werden in Strings dazu gezwungen und die zweite wird als ein sein (basic, a la GNU `grep ') regulären Ausdruck

In Grund GNU grep regex, nicht gierige Spiel Modifikator wird nicht unterstützt .

Betrachten andere Tools wie sed, awk, grep -P etc

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In Ihrem speziellen Beispiel (es wird nicht Zeilenumbrüche in Dateinamen sein), können Sie einfach tun echo "$vcfs" |grep "^dbsnp_[1-9][3-9][3-9].*\.vcf"