Stellen Sie sicher, dass numpy MKL-Bibliothek auf Mac Pro verwendet

Question

Ich verwende Enthought Canopy/EPD-Version von Python, die mit numpy gegen MKL geliefert wird. Ich führe gerade eine Reihe von Simulationen parallel (mit PP) auf meinem Arbeitscomputer (Windows 7, Quad Core i5 @ 3,33 Ghz, 4 GB RAM) und meine Heimarbeitsplatz (Mac Pro 3.1, Ubuntu 12.04, 2x Quad Core Xeon @ 2.8 Ghz, 6 GB RAM).

Aber wenn ich meine Simulationen benchmarken, laufen sie viel schneller auf dem Arbeitscomputer (35 Sekunden pro Iteration vs. 60 auf dem Mac Pro). Das Problem ist ein perfektes Gleichgewicht zwischen den Kernen (peinlich paralleles Problem), also vermute ich, dass es ein Problem mit der MKL-Bibliothek auf der Linux-Workstation zu Hause gibt. Gibt es eine Möglichkeit zu überprüfen, dass die MKL-Bibliothek tatsächlich in Python verwendet wird. Ich habe Threads gelesen, die sagen, dass Sie überprüfen können, ob Python mit ihm verknüpft ist, aber es stellt nicht sicher, dass es korrekt erstellt wurde und tatsächlich verwendet wird.

Answer 1

>>> numpy.show_config() 

Sie sehen eine Ausgabe wie diese, die zeigt, dass MKL tatsächlich verknüpft ist.

lapack_opt_info: 
    libraries = ['mkl_lapack95_lp64', 'mkl_intel_lp64', 'mkl_intel_thread', 'mkl_core', 'mkl_mc', 'mkl_mc3', 'pthread'] 
    library_dirs = ['/Users/vagrant/src/master-env/Resources/Python.app/Contents/MacOS/../../../../lib'] 
    define_macros = [('SCIPY_MKL_H', None)] 
    include_dirs = ['/Users/vagrant/src/master-env/Resources/Python.app/Contents/MacOS/../../../../include'] 
blas_opt_info: 
    libraries = ['mkl_intel_lp64', 'mkl_intel_thread', 'mkl_core', 'mkl_mc', 'mkl_mc3', 'pthread'] 
    library_dirs = ['/Users/vagrant/src/master-env/Resources/Python.app/Contents/MacOS/../../../../lib'] 
    define_macros = [('SCIPY_MKL_H', None)] 
    include_dirs = ['/Users/vagrant/src/master-env/Resources/Python.app/Contents/MacOS/../../../../include'] 
openblas_info: 
NOT AVAILABLE 
lapack_mkl_info: 
    libraries = ['mkl_lapack95_lp64', 'mkl_intel_lp64', 'mkl_intel_thread', 'mkl_core', 'mkl_mc', 'mkl_mc3', 'pthread'] 
    library_dirs = ['/Users/vagrant/src/master-env/Resources/Python.app/Contents/MacOS/../../../../lib'] 
    define_macros = [('SCIPY_MKL_H', None)] 
    include_dirs = ['/Users/vagrant/src/master-env/Resources/Python.app/Contents/MacOS/../../../../include'] 
blas_mkl_info: 
    libraries = ['mkl_intel_lp64', 'mkl_intel_thread', 'mkl_core', 'mkl_mc', 'mkl_mc3', 'pthread'] 
    library_dirs = ['/Users/vagrant/src/master-env/Resources/Python.app/Contents/MacOS/../../../../lib'] 
    define_macros = [('SCIPY_MKL_H', None)] 
    include_dirs = ['/Users/vagrant/src/master-env/Resources/Python.app/Contents/MacOS/../../../../include'] 
mkl_info: 
    libraries = ['mkl_intel_lp64', 'mkl_intel_thread', 'mkl_core', 'mkl_mc', 'mkl_mc3', 'pthread'] 
    library_dirs = ['/Users/vagrant/src/master-env/Resources/Python.app/Contents/MacOS/../../../../lib'] 
    define_macros = [('SCIPY_MKL_H', None)] 
    include_dirs = ['/Users/vagrant/src/master-env/Resources/Python.app/Contents/MacOS/../../../../include']