Kann nicht in interaktiven HTML-Outputs von R produzieren plotly Paket

Question

python flask So entwickle ich eine Webanwendung, die den Benutzer nach Daten fragt, analysiert die Daten im Back-End mit BLAST und R, und gibt interaktive HTML-Plots, die werden an einem lokalen Ort gespeichert (Vorlagen) und dem Benutzer angezeigt.

Alles bis R Ausgänge läuft reibungslos. Ich habe die HTML-Dateien geöffnet und bestätigt, dass die R-Codes wie erwartet ausgeführt wurden und die erstellten Grafiken interaktiv sind. Wenn ich diese HTML-Dateien über flask rendere, gibt der Browser eine schwarze Seite zurück. Die Verwendung von send_file war auch fruchtlos, um die Plots anzuzeigen. Ich habe bestätigt, dass der Pfad zu den Java-Skripten für das interaktive Diagramm im selben Ordner liegt.

Geht man durch die Entwickler-Tool Konsole liest den folgenden Fehler:

htmlwidgets.js:1 Uncaught SyntaxError: Unexpected token < 
jquery.min.js:1 Uncaught SyntaxError: Unexpected token < 
datatables.js:1 Uncaught SyntaxError: Unexpected token < 
jquery.dataTables.min.js:1 Uncaught SyntaxError: Unexpected token < 

Kann jemand bitte beraten, wie erfolgreich die interaktive R HTML-Ausgaben in flask zu zeigen zu bekommen?

Answer 1

Wenn Sie send_file oder send_from_directory verwenden, müssten Sie auch die JavaScript-Bibliotheken bereitstellen, die für das Diagramm benötigt werden. Dies könnte der Grund für die leere Seite sein.

Das gleiche gilt für render_template aber nach den Fehlermeldungen es scheint eher wie, dass Ihre JS-Bibliotheken wurden auch als Vorlagen gemacht und einige < oder > Charakter wurde hinzugefügt oder entfernt.

Probieren Sie das folgende Snippet, das für mich funktioniert und vielleicht einen guten Start gibt.

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Ein sehr einfaches R Skript eine eigenständige HTML-Datei mit einem Plotly Plot zu erstellen. Eine Datei mit dem Namen test.html wird im Verzeichnis /tmp erstellt. Alle JavaScript-Bibliotheken und CSS-Dateien befinden sich in /tmp/test_files.

library(plotly) 
library(htmlwidgets) 

myData <- data.frame(x=c(1,2,3), y=c(3,2,1)) 
local_path <- '/tmp/' 
ply <- plot_ly(myData, x = ~x, y = ~y, type='scatter', mode='markers+line') 
saveWidget(widget=ply, file=paste(local_path, "test.html", sep=""), selfcontained = FALSE) 

Ein minimaler Schnipsel Flask-Server ist unter den Plot und die JavaScript-Bibliotheken zu dienen. Startkolben und gehen in den Browser auf http://localhost:5000/ würde die Handlung zeigen und alle Bibliotheken zur Verfügung stellen.

from flask import Flask 
from flask import send_from_directory 
app = Flask(__name__) 

@app.route('/') 
def plotly(): 
    return send_from_directory('/tmp/', 'test.html') 

@app.route('/test_files/<path:path>') 
def send_js(path): 
    return send_from_directory('/tmp/test_files', path)