2017-10-05 2 views
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Der Versuch, eine csv mit read_csv Funktion zu lesen:Wie installiert man die Olson-Datenbank?

library(readr) 
read_csv("myfile.csv") 

kehrt Warnung:

Warning message in OlsonNames(): 
“no Olson database found” 

und dann Fehler:

Error: Unknown TZ UTC 
Traceback: 

1. read_csv("myfile.csv") 
2. read_delimited(file, tokenizer, col_names = col_names, col_types = col_types, 
.  locale = locale, skip = skip, comment = comment, n_max = n_max, 
.  guess_max = guess_max, progress = progress) 
3. col_spec_standardise(data, skip = skip, comment = comment, guess_max = guess_max, 
.  col_names = col_names, col_types = col_types, tokenizer = tokenizer, 
.  locale = locale) 
4. guess_header(ds_header, tokenizer, locale) 
5. guess_header_(datasource, tokenizer, locale) 
6. default_locale() 
7. locale() 
8. check_tz(tz) 
9. stop("Unknown TZ ", x, call. = FALSE) 

Ich nehme nicht diesen Fehler nicht in R zurück Studio also annehmen Olson Datenbank ist mit R Studio vorinstalliert?

Wie kann ich Olson-Datenbank auf R Jupyter Notebook installieren, damit read_csv wie erwartet ausgeführt wird?

Update:

Ich empfange gleichen Fehler rufenden OlsonNames() unabhängig auf Jupyter Notebook. Jupyter Notebook ich ausgeführt habe, ist, Container angegeben bei https://github.com/jupyter/docker-stacks/tree/master/r-notebook

Update 2:

R-Pakete wie von Docker-Datei angegeben:

# R packages 
RUN conda install --quiet --yes \ 
    'r-base=3.3.2' \ 
    'r-irkernel=0.7*' \ 
    'r-plyr=1.8*' \ 
    'r-devtools=1.12*' \ 
    'r-tidyverse=1.0*' \ 
    'r-shiny=0.14*' \ 
    'r-rmarkdown=1.2*' \ 
    'r-forecast=7.3*' \ 
    'r-rsqlite=1.1*' \ 
    'r-reshape2=1.4*' \ 
    'r-nycflights13=0.2*' \ 
    'r-caret=6.0*' \ 
    'r-rcurl=1.95*' \ 
    'r-crayon=1.3*' \ 
    'r-randomforest=4.6*' && \ 
    conda clean -tipsy && \ 
    fix-permissions $CONDA_DIR 

OS: Ubuntu Core-14.04

R Version:

[email protected]:~$ R -- version 
WARNING: unknown option '--' 

ARGUMENT 'version' __ignored__ 


R version 3.3.2 (2016-10-31) -- "Sincere Pumpkin Patch" 
Copyright (C) 2016 The R Foundation for Statistical Computing 
Platform: x86_64-pc-linux-gnu (64-bit) 

R is free software and comes with ABSOLUTELY NO WARRANTY. 
You are welcome to redistribute it under certain conditions. 
Type 'license()' or 'licence()' for distribution details. 

    Natural language support but running in an English locale 

R is a collaborative project with many contributors. 
Type 'contributors()' for more information and 
'citation()' on how to cite R or R packages in publications. 

Type 'demo()' for some demos, 'help()' for on-line help, or 
'help.start()' for an HTML browser interface to help. 
Type 'q()' to quit R. 

[Previously saved workspace restored] 

> 
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Erhalten Sie das, wenn Sie einfach 'OlsonNames()' ausführen? Dies ist eine Basis-R-Funktion und wenn das fehlschlägt, dann hat das nichts mit 'readr' oder möglicherweise RStudio zu tun (außer RStudio hat die R-Konfiguration kaputt gemacht) – Spacedman

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@Spacedman Bitte update sehen, erscheint Ich werde Docker Container aktualisieren müssen Dieses Jupyter Notebook basiert auf. –

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Woher kommt 'OlsonNexecutinames()'? Geben Sie auch Versionen von R, Betriebssystem und Paketen an. – Spacedman

Antwort

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Die OlsonNames funkt Ion ist ziemlich einfach. In 3.3.2 sieht es für die Zeitzone Namen in diesen Orten:

 tzdirs <- c(Sys.getenv("TZDIR"), file.path(R.home("share"), 
     "zoneinfo"), "/usr/share/zoneinfo", "/usr/share/lib/zoneinfo", 
     "/usr/lib/zoneinfo", "/usr/local/etc/zoneinfo", "/etc/zoneinfo", 
     "/usr/etc/zoneinfo") 

Sie müssen sicherstellen, dass eine der aufgelisteten Verzeichnisse zur Verfügung. Wenn sich keine der fest codierten Dateien auf Ihrem System befinden, setzen Sie TZDIR, um auf eine Kopie zu zeigen.

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