Handle C Behauptungen von Python

Question

ich folgende Python-Code verwendet, um eine DICOM-Datei mit GDCM zu komprimieren:

import gdcm 

    reader = gdcm.PixmapReader() 
    reader.SetFileName(str(source)) 
    if not reader.Read(): 
     raise BaseException("Could not read (pixmap) %s" % source) 
    image = reader.GetPixmap() 
    change = gdcm.ImageChangeTransferSyntax() 
    change.SetForce(False) 
    change.SetCompressIconImage(False) 
    transfer_syntax = gdcm.TransferSyntax(gdcm.TransferSyntax.JPEG2000Lossless) 
    change.SetTransferSyntax(transfer_syntax) 
    change.SetInput(image) 
    if not change.Change(): 
     raise BaseException("Could not change the Transfer Syntax: ") 
    .... 

In der Zeile change.Change(), gibt es eine Behauptung in GDCM Quelle die möglicherweise faile:

Assertion `((fragment_size + 1)/2) * 2 == ((image_height * image_width * numcomps * (bitsallocated/8) + 1)/ 2)* 2' failed. 

Leider würde der Python-Prozess im Falle eines Assertionsfehlers bei GDCM beendet werden. Gibt es eine Möglichkeit, solche Behauptungen zu behandeln (ohne die Bedingungen bei Python vor dem Aufruf von change.Change() überprüft zu haben)?

Answer 1

Zögernd überprüfte ich die Dicom Integrität pydicom vor Komprimieren Dicom mit:

def check_dicom(dicom_file): 
    p = dicom.read_file(dicom_file) 
    assert p.SamplesPerPixel in (1, 3) 
    if p.BitsAllocated % 8 != 0: 
     return False 

    # assert(((fragment_size + 1)/2) * 2 == ((image_height * image_width * numcomps * (bitsallocated/8) + 1)/ 2)* 2); 
    left = ((len(p.PixelData) + 1)/2) * 2 
    right = ((p.Rows * p.Columns * p.SamplesPerPixel * (p.BitsAllocated/8) + 1)/ 2)* 2 
    if left != right: 
     raise BaseException("DICOM attributes are in conflict with pixel data size") 
    return True 

Answer 2

Ein Weg, dies zu behandeln, ist einen untergeordneten Prozess zu starten, um die C-Bibliothek aufzurufen, und dann eine Ausnahme auszulösen, wenn der untergeordnete Prozess wegen einer C-Anweisung asyst abstirbt.