R nach mit fread falscher Anzahl von Dimensionen Fehlern ersetzt read.csv erscheint

Question

ich meine CSV-Datei mit einfachen Laden:

baseData <- read.csv(datafile) 

aber wie ich größere Datenmenge zu ladende habe ich ziehe nach data.table package

baseData <- fread(input = paste("zcat < ", datafile, sep="")) 

alles scheint gut zu funktionieren, und die Daten viel schneller lädt, aber wenn ich drücken Sie die folgende Zeile:

d <- baseData[baseData$some_prop==0,] 
d <- d[!is.na(d[,"col"]) & (d[,"col"] == 0 | d[,"col"] == 1),] 

Ich bekomme Fehler für incorrect number of dimensions

bei der Verwendung read.csv alles funktioniert gut. Irgendeine Idee, was kann falsch gehen?

Answer 1

In einer data.table soll der j Teil der Teilmenge einen neuen Wert zurückgeben und die Spaltennamen sollten nicht in Anführungszeichen gesetzt werden oder Sie erhalten genau diesen Wert zurück.

Beispiel:

>d<-data.table(A=1:5,B=5:10) 
> d[,A] 
[1] 1 2 3 4 5 1 
> d[,B] 
[1] 5 6 7 8 9 10 
> d[,"B"] 
[1] "B" 

Also für Sie besonderen Fall, um die Spaltennamen, die Anführungszeichen zu entfernen sollte den Fehler beheben.

Wenn Ihr Code ziemlich lang ist und data.frame Methoden verwenden, können Sie setDF(d) verwenden, um es vor dem Refactoring so wie es ist zu arbeiten.

vollständig, entstehen die Fehler, weil Ihre logische Aussage der Länge 1 ("col" == whatever einen Wert nur TRUE oder FALSE zurückkehren), nicht die Anzahl der Zeilen Ihres data.table Objekts entspricht.