Wie summiere ich eine Auswahl von Spalten?

Question

Ich möchte mehrere Spalten in einer Textdatei ähnlich wie dies zusammenzufassen:

GeneA Sample 34 7 8 16 
GeneA Sample 17 7 10 91 
GeneA Sample 42 9 8 11 

Ich möchte die Summe am unteren Rand der Spalten erzeugen 3-5 so wird es wie folgt aussehen:

GeneA Sample 34 7 8 16 
GeneA Sample 17 7 10 91 
GeneA Sample 42 9 8 11 
       93 23 26 

ich kann dies für eine einzelne Spalte verwenden, aber nicht wissen, wie eine Reihe von Spalten angeben:

awk -F'\t' '{sum+=$3} END {print sum}' input file> out 

Answer 1

der einfachste Weg für jede Spalte nur wiederholen Summieren ist, i.

awk -F '\t' '{ 
    s3 += $3 
    s4 += $4 
    s5 += $5 
} 
END { 
    print s3, s4, s5 
}' input_file > out 

Answer 2

In awk:

$ awk ' 
{ 
    for(i=3;i<=NF;i++)      # loop wanted fields 
     s[i]+=$i }       # sum to hash, index on field # 
END { 
    for(i=3;i<=NF;i++)      # same old loop 
     printf "%s%s",s[i],(i==NF?ORS:OFS) } # output 
' file 
93 23 26 118 

Derzeit ist die for Schleife geht durch jedes numerische Feld. Ändern Sie die Parameter bei Bedarf.

Answer 3

Versuchen Sie es. Beachten Sie, dass NF nur die Anzahl der Felder bedeutet. Die AWK-Indizierung beginnt mit 1. Das Beispiel hat also einen Bereich von 3 bis zum letzten col.

awk '{ for(i=3;i<=NF;i++) sum[i] += $i } END { for(i=3;i<=NF;i++) printf("%d ", sum[i]); print "" }' input_file 

Wenn Sie weniger Spalten wollen, sagen 3 und 4, dann würde ich vorschlagen:

awk '{ for(i=3;i<=4 && i<=NF;i++) sum[i] += $i } END { for(i=3;i<=4 && i<=NF;i++) printf("%d ", sum[i]); print "" }' input_file 

Answer 4

$ awk -v OFS='\t' '{s3+=$3; s4+=$4; s5+=$5; $1=$1} 1; 
       END {print "","",s3,s4,s5}' file 

GeneA Sample 34  7  8  16 
GeneA Sample 17  7  10  91 
GeneA Sample 42  9  8  11 
       93  23  26