Modellzusammenfassung in R-Abschrift drucken, ohne laufendes Modell

Question

Ich habe ein logistisches gemischtes Modell ausgeführt, das ungefähr 3 Stunden dauerte, um zu passen. Ich habe das Modell als Objekt in meiner globalen Umgebung gespeichert und möchte die Modellzusammenfassung in mein R-Abschriftdokument aufnehmen. Ich möchte jedoch nicht, dass knitr das Modell ausführt, wenn der HTML-Code zusammengefügt wird (das würde noch 3 Stunden dauern). Ich möchte nur die Zusammenfassung des Modells drucken, das ich bereits ausgeführt habe.

Knitr gibt einen Fehler aus, der besagt, dass das Modellobjekt nicht in seinem Gültigkeitsbereich liegt.

Wie bekomme ich knitr, um auf das Modellobjekt zuzugreifen, das ich bereits erstellt habe, und das Modell nicht erneut auszuführen, wenn ich das Dokument kompiliere?

Answer 1

Ich würde das Modell als RDS-Objekt speichern, und laden Sie es dann in das RMarkdown-Dokument. Sie können dann das RDS-Objekt laden, während Sie diese Tatsache ausblenden, wenn Sie den von Ihnen ausgeführten Code einfach darstellen möchten. Zum Beispiel finden Sie den Code, unter dem passen und sparen würde/nachladen ein lineares Modell:

fit <- lm(x ~ y) 
saveRDS(fit, "fit.RDS") 

Dann im RMarkdown Dokument

## (if you do not wish to hide the fact that you are loading it, then omit `echo = FALSE`) 
```{r, echo = FALSE} 
fit <- readRDS("fit.RDS") 
## To show the code that fit the model. 
## `eval = FALSE` means the code is not run while knitting. 
```{r, eval = FALSE} 
fit <- lm(x ~ y) 
``` 

Answer 2

Als erstes sollten Sie Ihren Arbeitsbereich mit ls() überprüfen. Wenn das Modell nicht vorhanden ist, müssen Sie es erneut ausführen. Wenn Sie es sehen, können Sie einfach die Zusammenfassung in der Konsole drucken. Wenn Sie versuchen, Ihr Dokument zu stricken, wird es die gesamte rmd