So füllen Sie die Kontur vollständig mit stat_contour

Question

Ich bin auf der Suche nach Möglichkeiten, die von ggplot2 stat_contour generierte Kontur vollständig ausfüllen. Das aktuelle Ergebnis ist wie folgt:

# Generate data 
library(ggplot2) 
library(reshape2) # for melt 
volcano3d <- melt(volcano) 
names(volcano3d) <- c("x", "y", "z") 

v <- ggplot(volcano3d, aes(x, y, z = z)) 
v + stat_contour(geom="polygon", aes(fill=..level..)) 

Das gewünschte Ergebnis kann durch die Codes manuell modifiziert wie folgt hergestellt werden.

v + stat_contour(geom="polygon", aes(fill=..level..)) + 
    theme(panel.grid=element_blank())+ # delete grid lines 
    scale_x_continuous(limits=c(min(volcano3d$x),max(volcano3d$x)), expand=c(0,0))+ # set x limits 
    scale_y_continuous(limits=c(min(volcano3d$y),max(volcano3d$y)), expand=c(0,0))+ # set y limits 
    theme(panel.background=element_rect(fill="#132B43")) # color background 

Meine Frage: die Farbe zu spezifizieren oder mit geom_tile() ist es eine Möglichkeit, ohne manuell vollständig die Handlung zu füllen?

Answer 1

Da @tonytonov diese thread vorgeschlagen hat, können die transparenten Bereiche durch Schließen der Polygone gelöscht werden.

# check x and y grid 
minValue<-sapply(volcano3d,min) 
maxValue<-sapply(volcano3d,max) 
arbitaryValue=min(volcano3d$z-10) 

test1<-data.frame(x=minValue[1]-1,y=minValue[2]:maxValue[2],z=arbitaryValue) 
test2<-data.frame(x=minValue[1]:maxValue[1],y=minValue[2]-1,z=arbitaryValue) 
test3<-data.frame(x=maxValue[1]+1,y=minValue[2]:maxValue[2],z=arbitaryValue) 
test4<-data.frame(x=minValue[1]:maxValue[1],y=maxValue[2]+1,z=arbitaryValue) 
test<-rbind(test1,test2,test3,test4) 

vol<-rbind(volcano3d,test) 

w <- ggplot(vol, aes(x, y, z = z)) 
w + stat_contour(geom="polygon", aes(fill=..level..)) # better 

# Doesn't work when trying to get rid of unwanted space 
w + stat_contour(geom="polygon", aes(fill=..level..))+ 
    scale_x_continuous(limits=c(min(volcano3d$x),max(volcano3d$x)), expand=c(0,0))+ # set x limits 
    scale_y_continuous(limits=c(min(volcano3d$y),max(volcano3d$y)), expand=c(0,0)) # set y limits 

# work here! 
w + stat_contour(geom="polygon", aes(fill=..level..))+ 
coord_cartesian(xlim=c(min(volcano3d$x),max(volcano3d$x)), 
       ylim=c(min(volcano3d$y),max(volcano3d$y))) 

Das Problem blieb mit diesem Tweak ist Methoden abgesehen von Versuch und Irrtum zu finden, die arbitaryValue zu bestimmen.

[Bearbeiten von hier]

Nur ein kurzes Update zu zeigen, wie ich die arbitaryValue bin zu bestimmen, ohne für alle Datensätze zu erraten ist.

BINS<-50 
BINWIDTH<-(diff(range(volcano3d$z))/BINS) # reference from ggplot2 code 
arbitaryValue=min(volcano3d$z)-BINWIDTH*1.5 

Dies scheint für den Datensatz, an dem ich gerade arbeite, gut zu funktionieren. Nicht sicher, ob mit anderen anwendbar. Beachten Sie auch, dass die Tatsache, dass ich hier einen BINS-Wert einstelle, erfordert, dass ich bins=BINS in stat_contour verwenden muss.

Answer 2

Danke für @ chengvts Antwort. Manchmal brauche ich diese Technik, also habe ich eine verallgemeinerte function() gemacht.

test_f <- function(df) { 
    colname <- names(df) 
    names(df) <- c("x", "y", "z") 
    Range <- as.data.frame(sapply(df, range)) 
    Dim <- as.data.frame(t(sapply(df, function(x) length(unique(x))))) 
    arb_z = Range$z[1] - diff(Range$z)/20 
    df2 <- rbind(df, 
       expand.grid(x = c(Range$x[1] - diff(Range$x)/20, Range$x[2] + diff(Range$x)/20), 
          y = seq(Range$y[1], Range$y[2], length = Dim$y), z = arb_z), 
       expand.grid(x = seq(Range$x[1], Range$x[2], length = Dim$x), 
          y = c(Range$y[1] - diff(Range$y)/20, Range$y[2] + diff(Range$y)/20), z = arb_z)) 
    g <- ggplot(df2, aes(x, y, z = z)) + labs(x = colname[1], y = colname[2], fill = colname[3]) + 
    stat_contour(geom="polygon", aes(fill=..level..)) + 
    coord_cartesian(xlim=c(Range$x), ylim=c(Range$y), expand = F) 
    return(g) 
} 

library(ggplot2); library(reshape2) 
volcano3d <- melt(volcano) 
names(volcano3d) <- c("xxx", "yyy", "zzz") 
test_f(volcano3d) + scale_fill_gradientn(colours = terrain.colors(10))