R Stacked Bars Grundstück mit ggplot 2
Ich mag würde% gestapelt Grundstück wie das Bild hochgeladen machen. Das ist mein Skript ist und ich erhalte die folgende Fehlermeldung:
gplot(data=res, aes(x=GO.term, y=up)) + geom_bar()
**Error: stat_count() must not be used with a y aesthetic.**
# Bar Grundstück für Begriffe GO
setwd("C:/Users/gmbz/Desktop/RNA analysis/Rscripts/Bar plot") #set up working directory
res <- read.delim("GOBarPlot.txt", header=TRUE)
head(res)
tail(res)
show(res)
library(ggplot2)
ggplot(data=res, aes(x=up, y=down, fill=GO.term)) + geom_bar()
Hier ist meine Daten:
Goterm up down
metal ion transmembrane transporter activity 10 90
translational elongation 22.22222222 77.77777778
metal ion transport 25 75
translation 30.08474576 69.91525424
aminoacyl-tRNA ligase activity 30.76923077 69.23076923
anchored component of membrane 33.33333333 66.66666667
apoptotic process 33.33333333 66.66666667
ribosome 34.11764706 65.88235294
regulation of cell cycle 35 65
translation elongation factor activity 35.71428571 64.28571429
cell wall 37.20930233 62.79069767
obsolete microsome 37.5 62.5
biosynthetic process 38.46153846 61.53846154
extracellular region 38.88888889 61.11111111
unfolded protein binding 42.10526316 57.89473684
protein folding 43.66197183 56.33802817
glutamine metabolic process 43.75 56.25
cellular amino acid metabolic process 46.875 53.125
fungal-type vacuole 48.61111111 51.38888889
glycolytic process 53.33333333 46.66666667
oxidoreductase activity 54.03225806 45.96774194
oxidation-reduction process 54.57875458 45.42124542
plasma membrane 55.6097561 44.3902439
regulation of cell size 57.14285714 42.85714286
cytosol 57.25806452 42.74193548
transmembrane transport 57.48792271 42.51207729
flavin adenine dinucleotide binding 62.16216216 37.83783784
metalloendopeptidase activity 63.15789474 36.84210526
transmembrane transporter activity 65.71428571 34.28571429
structural constituent of ribosome 66.34146341 33.65853659
chronological cell aging 66.66666667 33.33333333
transporter activity 69.33333333 30.66666667
mitochondrial inner membrane 72 28
substrate-specific transmembrane transporter activity 75 25
mitochondrial outer membrane 76.11940299 23.88059701
integral component of mitochondrial inner membrane 92.85714286 7.142857143
fungal-type cell wall 100 0
Jede Rückmeldung?
Frage Nr. 2. Wie kann ich die Schriftart der GOterms ändern, vorzugsweise in Times New Roman? ist das möglich?
Hey GGamba, erstaunlich !!! Danke vielmals. Es hat perfekt funktioniert – George
Jetzt habe ich eine andere Frage. Also habe ich einen größeren Datensatz von meinen RNAseq-Experimenten. Ich frage mich, wie man die GOterms aus der Excel-Tabelle konvertiert, um sie in R. lesbar zu machen. – George