plastan .plot() zeichnet Tracezusammenfassung zweimal auf

Question

Das ist wahrscheinlich eine blöde Frage, aber wenn ich die .plot() Funktion verwende, zeichnet sie die Zusammenfassung zweimal auf. Jeder weiß, warum es das tut und wie ich es stoppen kann?

Wie Sie sehen können, verwende ich Jupyter-Notebooks, wenn das wichtig ist.

es mit jedem stan Modell geschieht (und auf zwei getrennten Anlagen)

Dieser Code würde das Problem für mich produzieren

import pystan 
import numpy as np 
model_string = """ 
data { 
    int<lower=0> N; 
    int y[N]; 
} 
parameters { 
    real<lower=0, upper=1> theta; 
} 
model { 
    theta ~ beta(1,1); 
    y ~ bernoulli(theta); 
} 
""" 
N = 50 
z = 10 
y = np.append(np.repeat(1, z), np.repeat(0, N - z)) 
dat = {'y':y, 
     'N':N} 

fit = pystan.stan(model_code=model_string, data=dat, iter=1000, warmup=200, thin=1, chains = 3) 
fit.plot() 

Answer 1

Dies wird durch die %matplotlib inline Aussage verursacht wird, mehr Zeichnung als Sie es haben wollen . Die StanFit4Model.plot Methode ruft matplotlib.pyplot.subplot auf, und dieser Aufruf selbst wird eine Zeichnung zeichnen, wenn Ihr Notebook über %matplotlib inline verfügt. Dann gibt die Methode das Objekt Figure zurück. Wenn Sie es nicht erfassen, entscheidet sich Ihr Notebook, es Ihnen als Bild zu zeigen, anstatt den Typ zu drucken, und Sie erhalten die Doppelzeichnung.

Sie können ein einzelnes Diagramm ausgeben, indem Sie den Ausgang Figure erfassen. Ändern Sie den Code aus

fit.plot() 

statt zu

fig = fit.plot()