Ich zeichne einen PC-Plot mit ggplots. Ich weiß, dass diese Frage in einigen früheren Posts beantwortet wurde, aber ich konnte mein Problem immer noch nicht lösen. ich einen Datensatz haben Tab genannt, die die Ausgabe von PCA istText Annotation zu einem Graphen in ggplot
sample.id pop EV1 EV2
HT185_MK8-2.sort.bam HA_27 -0.03796869 0.046369552
HT48_SD1A-37.sort.bam HA_14 0.04208393 0.032961404
HT53_IA1A-10.sort.bam HA_1 -0.02580365 0.005262476
HT260_MK1-4.sort.bam HA_20 -0.06090545 0.005578504
HT170_SD2W-14.sort.bam HA_17 0.01288395 0.012117833
Q093_MK7-13.sort.bam HA_26 0.06310162 0.188558067
Ich möchte Etiketten in der Handlung auf jeden Punkt an, Thesen Punkte sind Individuen aus verschiedenen Populationen. Also möchte ich ihnen ihre Populations-ID geben (Pop-Spalte im Datensatz). Ich verwende etwas dieses
ggplot(data=tab,aes(EV1,EV2, label=tab[,2])) + geom_point(aes(color=as.factor(pop))) + ylab("Principal component 2") + xlab("Principal component 1")
Aber ich meine gewünschte Ausgabe nicht bekommen. Das ist mein PC-Plot! Also könnte mir jemand helfen, Population Label auf jedem Punkt in der Handlung hinzuzufügen! Dank
Was haben Sie unternommen, um Etiketten hinzuzufügen? Welche Frage hast du versucht zu beantworten und wo wurdest du verwirrt? – Gregor