Anova in Python Scipy verwenden, ohne

Question

in jedem Gruppennamen manuell eingeben

Ich habe eine df, die wie diese unten und nicht funktioniert

  Ens_prot_ID  Ens_gene_ID Sample  TPM  ppm ppm/TPM 
0  ENSP00000416240 ENSG00000109072 liver 2540.4 0.003 0.000001 
21597 ENSP00000226218 ENSG00000109072 liver 2540.4 110.000 0.043300 
... 

Der Code sieht gibt "KeyError: 0"

from scipy import stats 
proteins=df['Ens_prot_ID'].unique() 
stats.f_oneway([df[df['Ens_prot_ID'] == prot]['ppm/TPM'] for prot in proteins]) 

ich habe kein Problem läuft

from scipy import stats 
proteins=df['Ens_prot_ID'].unique() 
for prot in proteins: 
    df[df['Ens_prot_ID'] == prot]['ppm/TPM'] 

So ist es scheint, als ob das Problem ist f_oneway() nicht die Form der Eingabe mag. Gibt es eine Möglichkeit, die Funktion dazu zu bringen, Gruppennamen zu akzeptieren, die nicht von Hand eingegeben werden?

Answer 1

Sie können es auf diese Weise tun:

stats.f_oneway(*(df[df['Ens_prot_ID'] == prot]['ppm/TPM'] for prot in proteins)) 

Die * können Sie mehrere Argumente an eine Funktion zu übergeben: sehr https://pythontips.com/2013/08/04/args-and-kwargs-in-python-explained/

Ich habe auch die Liste Verständnis auf eine generator comprehension im Falle Ihrer DataFrame ist groß.