Pandas Dataframe aus PostgreSQL-Abfrage mit sqlalchemy zurückgeben

Question

Ich möchte eine PostgreSQL-Datenbank abfragen und die Ausgabe als Pandas-Dataframe zurückgeben.

I sqlalchemy verwenden, um eine Verbindung der die Datenbank zu erstellen:

from sqlalchemy import create_engine 
engine = create_engine('postgresql://user@localhost:5432/mydb') 

ich Pandas Datenrahmen zu einer Datenbanktabelle schreiben:

i=pd.read_csv(path) 
i.to_sql('Stat_Table',engine,if_exists='replace') 

Basierend auf dem docs, sieht aus wie pd.read_sql_query () sollte eine SQLAlchemy-Engine akzeptieren:

a=pd.read_sql_query('select * from Stat_Table',con=engine) 

Aber es t hrows ein Fehler:

ProgrammingError: (ProgrammingError) relation "stat_table" does not exist 

Ich benutze Pandas Version 0.14.1.

Was ist der richtige Weg?

Answer 1

Sie sind von den Fall (Un) Empfindlichkeitsprobleme mit PostgreSQL gebissen. Wenn Sie den Tabellennamen in der Abfrage zitieren, wird es funktionieren:

df = pd.read_sql_query('select * from "Stat_Table"',con=engine) 

Aber persönlich würde ich nur immer tiefer Fall Tabellennamen verwenden, raten (und Spaltennamen), auch wenn das Schreiben der Tabelle in der Datenbank zu verhindern solche Probleme.

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Aus der PostgreSQL-Dokumentation (http://www.postgresql.org/docs/8.0/static/sql-syntax.html#SQL-SYNTAX-IDENTIFIERS):

Quoting an identifier also makes it case-sensitive, whereas unquoted names are always folded to lower case

ein bisschen mehr zu erklären: Sie eine Tabelle mit dem Namen geschrieben haben Stat_Table auf die Datenbank (und sqlalchemy diesen Namen zitieren, so dass es wird in der Postgres-Datenbank als "Stat_Table" geschrieben. Wenn Sie die Abfrage 'select * from Stat_Table' ausführen, wird der Name der nicht angegebenen Tabelle in Kleinbuchstaben stat_table konvertiert, und Sie erhalten die Meldung, dass diese Tabelle nicht gefunden wird.

Siehe zB auch Are PostgreSQL column names case-sensitive?

Answer 2

Die Fehlermeldung sagt Ihnen, dass eine Tabelle mit dem Namen:

stat_table 

existiert nicht (a Beziehung ist eine Tabelle, in Postgres sprechen). Sie können also natürlich keine Zeilen daraus auswählen. Überprüfen Sie Ihre Datenbank nach der Ausführung:

und sehen, ob eine Tabelle mit diesem Namen in Ihrer Datenbank erstellt wurde.

Wenn ich Ihre Leseanweisung verwenden:

df = pd.read_sql_query('select * from Stat_Table',con=engine) 

ich die Daten wieder aus einer Postgres db, so gibt es nichts zu beanstanden.